Бонитировку проводят обычно в три приема: первый раз в молодом возрасте животного — по происхождению; второй раз — когда животное сформируется — по экстерьеру, конституции и рабочим качествам, и третий раз — после того, как животное дважды даст потомство — на основании оценки последнего. Каждый признак оценивают по бальной системе.
Племенных животных разводят не только для увеличения их числа, но и для того, чтобы с их помощью улучшить породу в целом. В тех случаях, когда улучшение требует очень большого количества животных, индивидуальная бонитировка их затрудняется, и ее заменяют классной. При классной бонитировке животных породы, которую хотят улучшить, разбивают на однородные группы, или классы. Обыкновенно при такой разбивке пользуются только данными экстерьера, конституции и продуктивности (рабочих качеств). Число классов определяется степенью разнородности животных. К первому классу относят наилучших по основным признакам животных, ко второму — имеющих небольшие отклонения от нормы и т. д. Животные каждого класса получают особую отметку. Классная бонитировка облегчает подбор производителей, так как при ней самцов подбирают не индивидуально к каждой самке, а к каждому классу в целом. При этом назначение самцов к самкам того или иного класса ведут с учетом, чтобы был получен приплод, лучший по сравнению с самками. Для этого самок первого класса кроют племенными самцами, а самок остальных классов, в зависимости от наличия производителей, кроют самцами высшего класса, исходя из правила, что худшее с лучшим улучшается.
В служебном собаководстве применяют только индивидуальную бонитировку. Центральный комитет служебного собаководства ДОСААФа ввел ее только в 1950 г. Согласно временной инструкции, бонитировку служебных собак приурочивают к июню — августу каждого года, и она проводится комиссиями с участием начальника местного клуба служебного собаководства, эксперта-кинолога, руководителя секции разведения клуба и ветеринарного врача. На каждую зарегистрированную в клубе собаку заводят специальный бонитировочный лист, в который заносят: 1) общие сведения о собаке с ее фотографией и данными о владельце, 2) сведения о поведении и рабочих качествах собаки, включая оценки, полученные ею на испытаниях, 3) подробное описание конституции и экстерьера собаки с основными промерами и оценками, полученными ею на выставках, 4) сведения о племенной деятельности кобеля или суки, включающие также результаты проверок семени у кобелей, 5) сведения о происхождении собаки на протяжении четырех поколений с общей оценкой каждого предка и 6) выводы и заключения по вопросу об использовании собаки для разведения. Материалы для бонитировки кладут в основу индивидуального подбора производителей при составлении плана вязок.