В итоге переговоры затянулись почти на год. Сапе-га был взбешен не слишком радушным приемом. Ему лишь удалось заключить перемирие на двадцать лет, а о военной помощи в борьбе со Швецией с ним никто даже не захотел говорить. Россия сохранила нейтралитет.
Чувствуя свою силу, Годунов решил сместить линию обороны против крымцев с окского рубежа к крепостям Царев-Борисов, Белгород и Валуйка. Их гарнизоны были укреплены, регулярно снабжались продовольствием и боеприпасами. Заградительные полки разместились у Мценска, Новосили и Орла. В будущем царь надеялся продвинуться еще южнее и запереть хана в Крыму.
В мирные годы стали бурно развиваться земледелие, ремесла и торговля. Ежегодно в Архангельский порт прибывали до тридцати кораблей из Англии, Голландии и Франции. Иностранные купцы скупали в большом количестве зерно, крупу и меха (на сумму до 50 000 рублей, — очень большую по тем временам), воск, мед, сало (до 40 000 фунтов в год), воловьи шкуры (до 100 000 штук), рыбий клей, ворвань, икру, лен, коноплю, слюду (ее называли русским стеклом) и даже соль. Русским людям они продавали драгоценности, предметы роскоши, пряности, металлические изделия и многое другое. Перечень заморских товаров велик, но в нем нет предметов первой необходимости и основных продуктов питания. Зато присутствуют жемчуг, изумруды, ожерелья, сукна, шелк, сафьян, вина, сахар, изюм, миндаль, лимоны, чернослив, рис, перец, гвоздика, корица, анис, кардамон, имбирь, мускатный орех, медь, олово, железо, свинец, порох, сера, бумага, ладан, зеркала, золотые и серебряные нити, мыло, сандал, киноварь, подсвечники, рукомойники, замки, погребцы, камфара, олифа, кисти и так далее. Все это покупалось представителями знати и было не слишком нужно простым людям, которые сами себя обеспечивали и пищей, и одеждой.
Таким образом, в первые два года правления Годунов стремился быть хорошим хозяином, всем нравиться и выполнять обещание, данное им во время венчания на царство. Писатель начала XVII века Авраамий Палицын сообщал об этом так:
В общении с подданными царь стремился быть приветливым, к челобитчикам проявлял чувствительность и милосердие. По его приказу в Кремле установили особый ящик, куда каждый человек мог опустить грамоту с жалобой или просьбой. Во время поездок государя этот ящик возили вместе с ним. Борис Федорович часто показывался на людях, демонстрируя свою величественную осанку, яркую внешность, степенность, роскошный наряд. Один из современников оставил словесный портрет царя:
Все знали, что Борис — очень хороший семьянин, ненавидит блуд, жестокость и не склонен к винопитию. Словом, он хотел во всем походить на идеального государя, но это ему не слишком удавалось. Многие замечали, что Годунов склонен к помпезности, очень тщеславен и пытается вознестись на небывалую высоту, слишком любит иностранцев и восхищается всем иноземным, а к русскому относится с некоторым пренебрежением. Он провозгласил себя продолжателем дел царя Федора Ивановича, но на самом деле совсем на него не похож. Некоторые даже стали задаваться вопросом: «А достоин ли Борис царского трона?»
Вполне вероятно, что мнительный Годунов вскоре заподозрил, что подданные относятся к нему совсем не так хорошо, как бы ему хотелось. Желая узнать тайные мысли возможных недругов, он решил официально узаконить систему доносов. В соответствии с ней, любой человек мог сообщить в Челобитный приказ о недоброжелательном отношении к царю или его родственникам кого угодно: своего господина, жены или мужа, сына или дочери и так далее. За донос челобитчик щедро вознаграждался. Например, холоп мог получить свободу, высокий чин и земельные владения виновного. Это привело к всеобщему развращению нравов. Некоторые слуги стали сговариваться между собой и писать поклепы на хозяев. Рассерженные жены строчили доносы на мужей. Даже дети, обиженные за наказания и запреты, пытались государевыми руками посчитаться с родителями.