План Свято-Андроникова монастыря. 1903. (Надпись «кабак» – поздняя.)
Храм мученика Евграфа. 1909. Уничтожен в начале 1930-х гг.
В 1933 году было решено уничтожить Спасский собор. Но реставраторам удалось доказать, что эта церковная постройка относится не к XIX веку, как предполагали раньше, а к средневековью. Собор и часть монастырского ансамбля были спасены. Уничтожили колокольню и несколько храмов.
Начало восстановительных работ
Спасо-Андроников монастырь. Рисунок П. Барановского. 1947
В 1947 году было принято решение поставить весь ансамбль монастыря на государственную охрану и присвоить ему статус памятника архитектуры всесоюзного значения. В Институте истории искусств Академии наук СССР 11 февраля 1947 года состоялось заседание, на котором сделал доклад один из крупнейших исследователей древнерусского зодчества Петр Дмитриевич Барановский, было составлено ходатайство в правительственные органы. И произошло невероятное – 10 декабря 1947 года вышло постановление правительства открыть на монастырской территории Музей иконописи имени Андрея Рублева. Вместе с Петром Барановским инициатива создания этого музея принадлежит ученым Игорю Грабарю, Николаю Воронину и Павлу Максимову.
К середине XIX века древний Спасский собор стал неузнаваем. К нему в 1846–1850 годах п проекту архитектора П.А. Герасимова пристроили приделы Успения Пресвятой Богородицы и преподобного Андроника, перестроили паперть, надстроили стены, вместо круглого барабана возвели восьмигранник с высоким шатровым завершением. Закомары и кокошники убрали под четерехскатную крышу. В итоге собор приобрел вид куба, увенчанного шатром и округленного с трех сторон папертью.
Спасский собор в первые десятилетия советской власти.
К реставрации собора сотрудники Музея древнерусского искусства, который размещался в зданиях Спасо-Андрониковой обители, приступили в 1950-х годах. Руководил работой архитектор-реставратор Л.А. Давид. Благодаря проделанной огромной научной работе были удалены все несуразные изменения XIX века, и ныне собор стал одним из лучших украшений Москвы. В 1989 году в нем были возобновлены богослужения.
Официальное открытие Центрального музея древнерусской культуры и искусства имени Андрея Рублева состоялось 21 сентября 1960 года и было приурочено к 600-летию со для рождения иконописца Андрея Рублева. Одна из сотрудниц музея Наталья Иванова вспоминала: «День был теплый и светлый. Никогда еще Андроников монастырь не видел такого скопления людей, соскучившихся по своей истории и жаждущих приобщиться к своим духовным корням. Митинг состоялся с западной стороны собора, около входа. Желающих поучаствовать в этом событии было так много, что людям пришлось стоять даже на длинной лестнице церкви архангела Михаила. Настоящий муравейник…»
Коллекция музея состоит из более чем тринадцати тысяч икон XII–XX веков, фресок, деревянных скульптур, рукописных и старопечатных книг, предметов медного художественного литья, шитья, изразцов, а также археологических находок.
По инициативе работников музея в 1985 году перед входом в Спасо-Андроников монастырь установили памятник величайшему русскому иконописцу Андрею Рублеву (скульптор Олег Комов).
Первый директор музея Д. Арсенишвили и первый научный сотрудник Н. Демина.
После реставрации 1998 года значительно расширилась экспозиция – новые выставочные пространства открылись в церкви архангела Михаила XVII века и трапезной палате XVI века. Память о первом директоре музея Давиде Арсенишвили и исследовательнице Наталье Деминой была увековечена памятными досками работы Зураба Церетели и Владимира Суровцева, открытыми в 2001 году на территории музея.