2 октября на заседании Реввоенсовета Республики в составе главнокомандующего И.И. Вацетиса, 2 членов совета И.Н. Смирнова и К.Х. Данишевского, с участием заведующего Оперода Наркомвоена С.И. Аралова, начштаба Управления делами Т.Н. Теодори и И.Д. Чинтулова и политкомиссара Оперативного отдела М.Г. Тракмана было принято решение о непосредственном подчинении Оперода со всеми отделениями Реввоенсовету Республики и переименовании отдела в Управление делами РВСР. В Управлении должна была сосредоточиться вся разведка и контрразведка, для чего туда передавались материалы бывшего Высшего военного совета, а также оперативного и военно-статистического отделов Всероссийского главного штаба. Управляющим делами должен был стать бывший заведующий Оперода С.И. Аралов, его заместителем бывший заместитель заведующего Оперода большевик В.П. Павулан, начальником штаба Управления делами РВСР — начштаба Г.И. Теодори.
14 октября 1918 г. РВСР объявил приказ № 94. 3-й пункт которого предписывал «руководство всеми органами военного контроля и агентурной разведки сосредоточить в ведении Полевого штаба РВСР». В соответствии с этим приказом из Военно-статистического отдела ВГШ была изъята агентурная разведка, и в отделе остались лишь региональные обрабатывающие отделения.
О содержании разведывательных сводок, которые выпускало Управление делами РВСР, дает представление перечень разделов «разведывательной сводки № 1576-Р/54». подписанной начальником Управления делами РВСР Араловым, начальником штаба Управления делами Теодори и заведующим 2-м (разведывательным) отделением Красновым. На двух страницах машинописи: «УКРАИНА: Организация украинской армии. Учреждения по воинской дисциплине, Дисциплинарный устав, Юнкерские училища, Кредиты по военному ведомству. Новый германский комендант г. Киева; ДОН — Приказы ген. Краснова. Призыв казаков. Разжалование ген. Болховитинова: ЯПОНИЯ — Большая военная программа» (далее следует перечень разделов. —
Однако новая структура — Управление делами РВСР. при не расформированном Опе-роде, просуществовала чуть больше месяца, создав неразбериху и путаницу. В итоге во изменение постановления Реввоенсовета Республики от 2 октября 1918 г. — Управление делами РВСР создали на базе Управления делами Наркомвоена, а на основе штаба Высшего военного совета и Оперода Реввоенсовета создали Полевой штаб РВСР. К моменту создания Полевого штаба число сотрудников Оперода составляло 295 человек.
Ноябрь 1918 — сентябрь 1919
Г.И. Теодори в «Кратком очерке истории Оперода Наркомвоена», написанном в 1920 г., перечисляя свои заслуги, заявил: «…Особенно тяжелая работа выпала на долю Оперод Нар-комвоен при формировании Полевого штаба из бывшего Высшего военного совета и Оперод Наркомвоен. Надо было с 16 октября по 11 ноября 1918 г. (за 24 дня), ни на секунду не прерывая работ по управлению фронтами, сформировать Полевой штаб. Управление [делами] Реввоенсовета Республики. Регистрационное управление. Курсы разведки и военного контроля при Реввоенсовете Республики, заново создать военно-цензурный отдел и выделить работников к тов. Троцкому. Задачи исключительно трудные, сложные и ответственные даже при нормальных условиях. А ведь их надо было выполнить при бедности политическими и военными работниками… в революционное время и в период военных действий, с особенной силой вспыхнувших на Южном фронте (Краснов). Тем не менее, к 10 ноября были сформированы: 22) Полевой штаб… 23) Регистрационное управление, т. е. положено начало организации военной агентурной разведки: контрразведке, или военному контролю. Фактически работа началась лишь в последних числах декабря, когда были собраны агенты; разработаны, совместно тт. Трейером и Батуриным военно-цензурные положения… 24) К 26 октября закончено формирование единственных в Европе курсов военного контроля и разведки, основателем их — тов. Теодори. Положения, штаты и инструкции одобрены и утверждены тов. Троцким. В основу преподавания и практических работ положен богатый опыт мировой и Гражданской войн». Не следует исключать преувеличение Теодори своей роли в создании Полевого штаба, однако и не следует умалять его роль.
1 ноября вышел приказ о расформировании Оперативного отдела Наркомвоена. Все. кто не хотел покидать Москву и отправляться в Серпухов, на место дислокации Полевого штаба, обязывались сообщить об этом через своих начальников Теодори. Ликвидировали дела Генштаба В.Ф. Тарасов, большевики В.Ф. Семенов и Е.В. Гиршфельд. 4 ноября приказом по Опероду объявлялось решение о назначении в Полевой штаб 175 сотрудников Оперативного отдела Наркомвоена. 5 ноября — еще 11 человек.