Численность и организационно-штатная структура азербайджанских ССО, входящих в состав вооруженных сил республики, засекречена. Судя по некоторым азербайджанским источникам, сухопутные силы специального назначения подчиняются непосредственно Генеральному штабу министерства обороны Азербайджана.
Изначально у Азербайджана предположительно была как минимум одна бригада специального назначения (в/ч 052), которую неофициально называли «Яшма», по месту постоянной дислокации в одноименном населенном пункте в Хызинском районе Азербайджана. До сих пор так часто называют и весь азербайджанский армейский спецназ. Исходя из сообщений о создании новых частей специального назначения, их численность постоянно росла в последние годы.
В апреле 2015 г. состоялось вручение боевых знамен созданным воинским частям спецназа, причем на кадрах с церемонии можно заметить вручение трех знамен, на двух из которых различимо слово «briqada» (что в переводе и означает «бригада»), то есть среди трех новых частей, похоже, было как минимум две бригады. В июне 2020 г. состоялось открытие еще одной новой воинской части сил специального назначения.
Для подготовки азербайджанских ССО был создан учебный центр «Шубаны», который в апреле 2019 г. посещал президент Ильхам Алиев.
Помимо ССО министерства обороны Азербайджана, дислоцированных в основной части республики, имеется также одна бригада специального назначения, состоящая из четырех батальонов, которая входит в состав 5-й отдельной общевойсковой армии Азербайджана на территории Нахичевани. Ее командиром последние годы является полковник Техран Мансимов. Во время Второй карабахской войны, 10 октября 2020 г., два батальона этой бригады были переброшены на фронт, 15 октября — еще один батальон. В ходе парада в декабре 2020 г. в честь победы в войне парадный расчет военнослужащих спецназа этой армии также шел отдельно от парадных расчетов сил специального назначения.
До сих пор в некоторых статьях азербайджанский спецназ неофициально называют «голубыми беретами», что в данное время неверно. Даже на кадрах вышеупомянутого вручения боевых знамен новым частям сил специального назначения в 2015 г. военнослужащие одной части были в голубых беретах, а двух других — в бордовых. По кадрам с учений, парадов и других мероприятий складывается устойчивое впечатление, что именно военнослужащие в бордовых беретах составляют большую часть азербайджанского армейского спецназа сегодня. Можно предположить, что выбор бордовых беретов был определен тем, что в подготовке большей части азербайджанских ССО ведущую роль играли инструкторы и советники турецкого командования специальных сил. Именно бордовый берет сейчас носит и сам командующий Силами специальных операций министерства обороны Азербайджана генерал-лейтенант Хикмет Мирзоев.
Прием в силы специального назначения Азербайджана проводится на добровольной основе. Военнослужащие должны сдать нормативы по физической подготовке и успешно пройти шестимесячный подготовительный курс, в ходе которого проверяется способность сохранять боеготовность в любой обстановке. Подготовка ведется в разных условиях: на земле, в воде и в небе. Военнослужащие обучаются как морскому, так и воздушному десантированию, в том числе с помощью парашюта. Одно из основных требований к кандидатам — знание нескольких иностранных языков.
Если базовая первоначальная подготовка военнослужащих азербайджанского спецназа осуществляется в собственном специальном учебном центре, то в ходе дальнейшей подготовки военнослужащих отправляют и в иностранные военные учебные центры в некоторых европейских и азиатских странах. Наиболее активно подобное сотрудничество развито опять же с Турцией. Согласно некоторым источникам, подготовка азербайджанских спецназовцев в прошлом проходила на территории Турецкой Республики Северного Кипра. В последнее время стало известно о прохождении военнослужащими азербайджанских сил специального назначения шестинедельных курсов подготовки в турецком учебном центре сил специального назначения в городе Испарта.
В составе ВМС Азербайджана действует собственное специальное подразделение — морской разведывательно-диверсионный центр специального назначения. Центр создан на базе бывшего морского разведывательного пункта Каспийской флотилии ВМФ СССР, расположен на мысе Зых в районе Баку и использует инженерно-водолазный полигон со стрельбищем на острове Вульф в Бакинской бухте.
Наподобие Турции, спецназ ВМС Азербайджана делится на отряды или группы подводного нападения (Sualt Hucum или сокращенно SAH) и подводной обороны (Sualt Mudafi или сокращенно SAM). Первая группа специализируется на разведывательно-диверсионной деятельности, а вторая — на борьбе с подводными диверсантами, защите военно-морских баз и других важных объектов от диверсий и терактов.