Напротив Мавзолея находится изящный по пропорциям маленький храм Юпитера с криптой в цокольном этаже. В былые времена его портик хорошо просматривался от Перистиля — сейчас храм скрыт более поздними постройками. Первоначально он был посвящен Асклепию, древнегреческому богу врачевания, который почитался иллирийцами на всем побережье Адриатики еще со времени появления первых греческих поселений. До наших дней прекрасно сохранилась вся центральная часть храма. Это — прямоугольное, стоящее на высоком основании здание, под двускатной крышей, с гладкими стенами, выложенными из ровных квадров светлого камня. Стройность и общее изящество его подчеркивают расположенные по углам пилястры с резными капителями. Небольшой фриз в верхней части и карниз крыши украшены резным орнаментом. С западной стороны храма раньше находился шестиколонный с фронтоном портик. Сейчас можно видеть только редкую по красоте дверь с резным антаблементом на скульптурных консолях. Последний богато орнаментирован рельефным плетением из акантовых листьев с включением фигурок детей, птиц, грифонов и ритмично стоящих между ними ваз. Мастерски выполненная, эта резьба заслуживает очень высокой оценки.
Внутри храма имеется единственное небольшое прямоугольное помещение с гладкими стенами. Обращает на себя внимание скульптурное оформление резного карниза, где можно увидеть ставшие впоследствии классическими все основные мотивы античного орнамента — овы, трилистники, пальметы, листья аканта, бусины. Зал перекрыт кессонированным коробовым сводом.
В эпоху раннего средневековья храм был превращен в баптистерий- крещальню Иоанна Крестителя. Здесь был погребен один из первых ревностных организаторов сплитской христианской церкви, епископ Иоанн из Равенны (Иоанн Равенский), его саркофаг помещен у западной стены. Вот почему много веков спустя крупнейший скульптор Югославии XX века Иван Мештрович исполнил специально для этого храма бронзовую золоченую фигуру Иоанна Крестителя, она поставлена у стены, напротив входа.
Еще в XI столетии в храме была установлена алтарная каменная преграда, исполненная /Местными скульпторами и резчиками по камню. Это великолепный образец раннесредневекового искусства Далмации. Почти всю поверхность преграды покрывает редкой красоты плетеный орнамент. В центре — рельефная композиция: на троне восседает хорватский король в высоком головном уборе с крестом в правой поднятой руке; перед ним пал ниц человек, видимо проситель; слева — фигура стоящего мужчины, Это одно из самых ранних в средневековой пластике изображение события из реальной жизни. Несмотря на некоторую неуклюжесть фигур, статичность, сцена в целом очень выразительна.
Перед входом в храм, как бы охраняя его, лежит египетский сфинкс, когда-то украшавший портик Мавзолея.
Храм Юпитера, Мавзолей, Перистиль и Вестибюль — вот сооружения, которые сохранились на территории дворца Диоклетиана от античных времен.
В последующие века после смерти Диоклетиана на месте разрушенных стен и частей дворца были возведены новые здания. Иначе стали использоваться старые античные постройки: главный зал — Перистиль — превратился в главную площадь города, Мавзолей и маленький храм Юпитера — в кафедральный собор и баптистерий. Нарядная галерея — променад в южной стене дворца- была частично уничтожена. Обширные подвальные помещения и цокольный этаж — завалены строительным мусором, а затем и вековыми отходами города. Улицы, когда-то широкие, украшенные колоннадой, превратились в узкие проулки.
Однако и сейчас, несмотря на почти сплошную застройку, еще очень много фрагментов старого античного дворца можно встретить в средневековых и более поздних домах, главным образом на месте бывших покоев императора. Так, на юго-восточной стороне дворца, в здании церкви св. Клары, обнаружены части стен большой столовой, восьмиугольного зала и трех примыкающих к нему небольших крестообразных в плане помещений. На улице св. Ивана, идущей от Перистиля к храму Юпитера, находится комплекс зданий, включающих в себя остатки Диоклетианова дворца — его маленького круглого храма Кибелы и храма Венеры. На улице Бувины (в юго-западной части дворца), в подвальных и цокольных этажах современного отеля «Славия» хорошо видны фрагменты стен терм Диоклетиана, некогда состоявших из большого числа комнат различного размера.