Однако среди торжествующего большинства тотчас обнаружилось разногласие. В их основе лежало различное толкование руководившего гуситством принципа держаться св. Писания или, как выражались чехи, «Божьего закона». В результате чего возникло два направления: консервативное, которое выступало за сохранение в церкви и жизни всего, что не противоречило св. Писанию, и радикальное, считавшее необходимым безусловно следовать св. Писанию и отменить все, что не находило прямого подтверждения в его тексте. Умеренного направления держалось высшее дворянство, а также горожане Праги и магистры Пражского университета. Предводителями радикального направления являлись народные проповедники, поддерживаемые населением сел и небольших городов, преимущественно на юго-западе Чехии. Когда Вацлава IV приказал в 1419 году восстановить на места католических священников, гуситские проповедники городка Аусти стали вести свои проповеди невдалеке от города, на холме, который был прозван горой Таборской и на котором позже, в 1420 году возник хорошо укрепленный город Табор. Отсюда пошло и название направлений: пражане, которое впоследствии было заменено на чашники и табориты. Оба течения были согласны между собою в общих требованиях, впервые формулированных в 1420 году в так называемых Четырех пражских статьях, когда Сигизмунд, разбитый под Прагою на Жижковой горе, заявил желание вступить в переговоры с победителями. Статьи заключали в себе требования: 1) свободной проповеди Божьего слова; 2) причащения под обоими видами; 3) секуляризации владений церкви и духовенства и 4) строгого преследования преступлений и пороков – смертных грехов, к которым помимо уголовных преступлений причислялись разврат, пьянство, обман, ростовщичество и всякое вымогательство, особенно со стороны духовных лиц.
Не довольствуясь этим, табориты представили несколько дней спустя пражанам двенадцать статей, в которых была выражена их точка зрения. Среди которых они отвергали догмат о пресуществлении, чистилище и учение о предстательстве святых; требовали сокращения обрядов, установленных для крещения и причащения, устранения икон, мощей, поста как средства покаяния, уничтожения праздников, кроме воскресенья, наконец, избрания епископов священниками.
Табориты требовали искоренения всего языческого, а под этим разумели все римское и немецкое; пуританство их выражалось в устранении всякой роскоши в богослужении, исключительном праздновании воскресения, в строгой нравственной дисциплине и в недопущении клятвы.
При сильном религиозном брожении, господствовавшем у таборитов, среди них возникали секты с крайним и даже уродливым направлением: хилиасты, убежденные в наступлении конца мира; адамиты, полагавшие, что они возвратились к райской невинности, к безгрешному состоянию, когда человеку все дозволено; наконец, секты коммунистические, переносившие идею осуществления «божеского закона» из области религиозной на житейскую почву, в область правовых отношений о собственности. Но эти вырождения религиозного фанатизма скоро были подавлены самими таборитами.
Желание Сигизмунда восстановить свои наследственные права над чешскими землями и подавить в них ересь вызвало гуситские войны, продолжавшиеся 11 лет, с 1420 по 1431 год. Эти войны, прославившие гуситов, представляют замечательное соединение религиозного одушевления и воинственности, образцом которого являлись гуситам ветхозаветные евреи и повторение которого впоследствии представляли пуритане Кромвеля. Подобно избранному народу, гуситы отожествляли «врагов Божиих» с врагами чешской нации – и это придавало им непобедимую отвагу.
Гуситские войны делят на два периода:
1) до 1427 года гуситы держатся оборонительного положения и победоносно отбиваются под предводительством Яна Жижки от Сигизмунда и «крестоносцев»;
2) с 1427 года гуситы переходят в наступление и опустошают год за годом все соседние области.
В Базеле собирается новый собор, на который король Сигизмунд приглашает и чехов. Кардинал Чезарини, в качестве папского легата руководил последним крестовым походом против гуситов и был свидетелем страшного поражения крестоносцев при Таусе (14 августа 1431 г.), был одним из главных деятелей в Базеле и употребил все свое влияние, чтобы устроить примирение с гуситами. После долгих тщетных переговоров 30 ноября 1433 года подписано, наконец, соглашение (компактаты), в силу которого собор разрешил желающим причащение под обоими видами (как это и предлагал Гус); остальные же три пражские статьи были признаны номинально и с уничтожавшими их смысл оговорками. Так как это соглашение не удовлетворило многих гуситов, среди них возникло разногласие, приведшее к военному столкновению, во время которого табориты были наголову разбиты при Чешском Броде (30 мая 1430 г.).
Религиозные диспуты и мирные переговоры между обеими гуситскими партиями продолжались до Пражского сейма 1444 года, на котором учение таборитов было объявлено заблуждением.