В рамках противодействия фашистской агитации «смершевцы» предлагали командному составу и политаппарату усилить воспитательную работу на переднем крае и принимать срочные меры к сбору и уничтожению вражеских листовок. Бойцам всех частей фронта надлежало разъяснить, что хранение вражеских листовок есть уголовно наказуемое деяние. В то же время было хорошо известно, что в подавляющем большинстве случаев эти листовки использовались лишь для бытовых нужд из-за нехватки бумаги. Нередко бойцы, не особенно задумываясь, отправляли родным послания, написанные по той же причине на оборотной стороне германских листовок. Поэтому наряду с коллективной читкой газет, беседами, иными формами воспитательной работы контрразведчики предлагали армейскому начальству срочно изыскать источники снабжения солдат, хотя бы на передовой, курительной и писчей бумагой. В первой половине июля 1943 года военный совет разработал и разослал по соединениям специальные приказы об усилении контрпропаганды и о «наведении порядка» на переднем крае обороны. Тогда же (14 июля) генерал-майор Я.А. Едунов в докладной записке начальнику ГУКР «СМЕРШ» НКО СССР комиссару государственной безопасности 2 ранга В.С. Абакумову отмечал: «По нашим материалам военный совет фронта принял меры через командование дивизий к укреплению переднего края, и уже на 1 июля только по 1 УА сооружено оборонительных укреплений протяженностью 20 км».
Однако быстро добиться решительных успехов в укреплении порядка и дисциплины на переднем крае не удавалось. Сотрудники «СМЕРШа» подполковник Васильев и капитан Демин в ходе проверки качества профилактической работы в штрафных ротах 245-й стрелковой дивизии обратили внимание на неудовлетворительное состояние переднего края обороны. Вместо парных были выставлены одиночные посты, оставались «открытыми» участки дороги протяженностью до 1000 м. Аналогичное положение было также выявлено в 23-й гвардейской, 282-й и 391-й стрелковых дивизиях.
Поскольку главные трудности возникали именно в области «наведения порядка» в окопах, контрразведчики методично работали над реализацией своего проекта обеспечения непроницаемости переднего края. Расследования по фактам исчезновения бойцов с передовой, проводившиеся сотрудниками «СМЕРШа», помогали вскрывать серьезные недостатки в организации обороны. В сентябре 1943 года из частей того же Северо-Западного фронта исчезли 20 человек, в том числе 12 из 200-й стрелковой дивизии. Выяснением обстоятельств чрезвычайного происшествия занимались заместитель начальника фронтового управления «СМЕРШ» полковник Казакевич и заместитель начальника 3-го отдела этого управления подполковник Нейман. Они установили, что из 12 исчезнувших трое были похищены разведкой противника, один однозначно перешел к врагу самостоятельно, трое, возможно, сделали это, а пять человек были объявлены в розыск как дезертиры.
По мнению контрразведчиков, на переднем крае дивизии «отсутствовал элементарный порядок». Впереди рубежа не было проволочных заграждений и минных полей. В 648-м полку неохраняемые промежутки между взводами достигали 500 м. Как показала проверка, бдительность часовых была низкой. И неудивительно: большинство постов — одиночные, смена часовых — не по уставу. Например, младший сержант Климов бессменно находился на огневой точке у пулемета трое суток.
Все это способствовало успехам разведки противника, которая получила возможность безнаказанно похищать наших солдат. О выявленных недостатках генерал-майор Я.А. Едунов вновь информировал военный совет фронта, утверждая, что реальные меры для наведения порядка на передовой до сих пор не приняты. В октябре приходилось повторять те же замечания и предложения, что прозвучали впервые еще в июне.
Военная контрразведка в борьбе с изменой активно использовала специальные методы. С помощью войсковой агентуры контрразведчики выявляли военнослужащих «с изменническими намерениями». В ряде случаев при получении оперативных материалов таких военнослужащих переводили в тыловые подразделения, где продолжалась их проверка. Например, по информации отдела «СМЕРШ» 22-й армии о наличии большого количества военнослужащих с изменническими настроениями в 11-й мотострелковой бригаде военный совет фронта снял подозрительных лиц с переднего края, заменив их комсомольцами.
В тех случаях, когда проверка подтверждала первоначальные подозрения, следовал арест. Например, в июне 1943 года контрразведка Северо-Западного фронта арестовала за «изменнические настроения» 82 человека, в том числе ликвидировав 12 «изменнических групп».