15 декабря на заседании были допрошены В.И. Комаров, М.Т. Лихачев, А.Г. Леонов и И.А. Чернов. Все они, кроме Чернова, отрицали очевидные факты своей виновности, пытаясь оправдаться, неоднократно ссылались на указания «высшей инстанции». Так, Комаров заявил, что указания по Ленинградскому делу им были получены лично от «высшей инстанции». Лихачев, пытаясь обелить свои преступные действия в деле П.С. Жемчужиной, заявил, что он создал ей в тюрьме особо благоприятные условия, за что она характеризовала его как чуткого и отзывчивого человека. Комаров, Леонов и Лихачев, отказались от ранее данных показаний, ссылаясь на применение к ним мер физического воздействия [9, л. 133–134].
В первой половине заседания, 16 декабря был допрошен Абакумов. Он отрицал свою вину по всем пунктам предъявленного обвинения, утверждая, что дело против него сфальсифицировано. Однако было доказано, что он являлся ближайшим сообщником Берия. Абакумов вновь объяснял свои преступления ссылками на указания «высшей инстанции», утверждая, что он не проявлял никакой инициативы в создании «Ленинградского дела».
На суде раскрылась роль Абакумова в деле Константина Орджоникидзе, просидевшего в одиночной камере 12 лет. Как выяснилось он по прямому указанию Л.П. Берия и В.Н. Меркулова продлил в 1946 г. через Особое совещание срок его тюремного заключения на 5 лет. Леонов и Комаров, состряпали документ, обвинявший его в антисоветской деятельности.
Абакумов на протяжении всего допроса отрицал бесспорные факты, заявлял, что его подписи являются подделкой. Пытался опорочить решения Верховного Суда СССР по реабилитации лиц, ранее осужденных по материалам МГБ СССР.
После допроса Абакумова были выслушали показания свидетелей: И.И. Штейнберга, С.И. Мельник-Соколинской, Н. Коннель, И.М. Турко, Т.В. Закржевской и А.А. Афанасьева. В своих показаниях они изобличали Абакумова и его сообщников во враждебных действиях, направленных на ослабление Советского государства.
Так, Штейнберг показал, что подсудимый Комаров, выполняя преступное указание Абакумова, путем непрерывных ночных допросов в течение семи дней лишал его сна. На допросах систематически избивал резиновыми палками, вынуждая подписывать вымышленные показания, угрожал арестом жены.
Свидетельница С.И. Мельник-Соколинская изобличала Комарова и Абакумова в применении к ней истязаний в процессе допроса, а также в произволе по пересмотру ими же сфабрикованного дела. Достаточно ей было из лагеря написать письмо родственникам с изложением некоторых фактов проявленного к ней беззакония, как ей немедленно заменили содержание в лагере строгим тюремным заключением.
Свидетельница Н. Коннель показала, что она по ложному обвинению в 1939 г. была осуждена Особым совещанием на 5 лет. В 1949 г. Абакумов и его сообщники вновь арестовали ее. В течение девяти месяцев содержали в одиночной камере, беспрерывными ночными допросами добивались от нее клеветнических показаний на Жемчужину.
И.М. Турко рассказал, как в отношении него было фальсифицировано следствие. Доведенный постоянными избиениями и пытками до полного изнеможения, он подписал так называемый обобщенный протокол допроса. За семь дней до суда Турко по указанию Абакумова улучшили питание и провели необходимую подготовку к суду. В течение ночи перед судом следователь Путинцев заставил Турко наизусть заучить обобщенный протокол допроса, а Комаров заявил ему, что он обязан повторить на суде содержание протокола и добавил, что суд пройдет, а он в МГБ останется и после суда.
Свидетельница Т.В. Закржевская показывала, что обвиняемые Комаров и Путинцев, несмотря на ее беременность, систематически истязали ее и постоянными угрозами и шантажом вынуждали подписать сфабрикованные показания.
Выступивший в качестве свидетеля следователь А.В. Путинцев заявил, что Абакумов и Комаров запрещали следователям вести протоколы допроса обвиняемых до специальных указаний и заставляли избиениями и пытками добиваться у обвиняемых требуемых показаний. В.К. Носов и А.А. Болховицын — быв. работники следственной части МГБ СССР также показали суду о творимых беззакониях в ведении следствия.
В конце судебного заседания были заслушаны свидетельские показания бывшего министра морского флота А.А. Афанасьева, рассказавшего о зверских приемах ведения следствия Абакумовым, Комаровым и другими. Садист Комаров в течение 30 дней истязал его постоянным избиением резиновыми палками, многодневным лишением сна и содержанием в карцере. Вынуждая его подписать обобщенный протокол, Комаров заставлял выслушивать нечеловеческие крики арестованных, избиваемых в соседних комнатах. Афанасьев рассказал, что Комаров неоднократно угрожал переломать ему ноги и одну руку, сохранив другую, чтобы он мог подписать нужные показания.
17 декабря в судебном заседании продолжалось слушание свидетельских показаний. Выступили свидетели: А.И. Шахурин, А.А. Новиков, Н.С. Шиманов, А.В. Будников, В.В. Карев, В.Н. Иванов, Хомич, Л.С. Коровин, Молочников, Жаров и А.И. Иванов и др.