Мартовское решение об остановке строительства субмарин специального назначения отразилось также на постройке лодок типа AM, число которых лимитировали четырьмя единицами. I-1 была заложена в Кобе 10 июня 1944 г., но работы по ее постройке были остановлены на стадии 70 % готовности. I-13, первую лодку типа AM, завершили постройкой 16 декабря 1944 г., I-14 – 14 марта 1945 г. Достройка лодки I- 15, доведенной до 95 % готовности, была прекращена. Таким образом, флот имел в своем распоряжении всего несколько подводных тяжелых авианесущих крейсеров, из-за чего необходимость в массовой постройке самолетов для них отпадала сама по себе. На момент прекращения программы постройки субмарин должно было быть построено 44 самолета «Сейран», реально же к концу марта 1945 г. заказчик получил всего 14 «Сейранов». Однако производство комплектующих для «Сейранов» на разных предприятиях все еще продолжалось, поэтому решили приспособить для базирования на сухопутных аэродромах. Таких «Сейранов» собрали шесть.
В конце осени 1944 г. в составе Императорского флота началось формирование авиационного корпуса специального назначения, на вооружение которого должны были поступить самолеты «Сейран», базировавшиеся на подводных лодках. Тщательно отбирались летные экипажи и технический персонал. 15 декабря в командование первого подразделения специального назначения (663-кокутай) вступил коммендер Тацуноке Арицуми. Кокутай входил в состав 1-коку сентай, сформированного в составе 1-й эскадры подводных лодок. В эскадру входило субмарине I-400,I-401 и лодки типа AM -I-13 и I-14. Четыре лодки могли нести десять «Сейранов» в общей сложности.
Первый учебный поход, в ходе которого с катапульты субмарины стартовал «Сейран», состоялся в январе 1945 г. Учебные плавания проводились во Внутреннем море южнее базы Курэ. «Сейраны» в количестве шести штук постоянно базировались на военно-морскую базу Фукуяма. Немало проблем летчикам и техникам доставила ненадежная работа двигателей «Ацута». Комбинированные учения лодок и самолетов, намеченные на 2 апреля так и не сумели провести из-за нехватки авиационного бензина, все резервы которого уходили самолетам, непосредственно задействованным в боевых действиях. В этих условиях субмарина I-401 была направлена в маньчжурский порт Дайрен, где топлива хватало. Перед переходом лодка получила фальшивую надстройку, создававшую у стороннего наблюдателя впечатление, будто бы он видит надводный корабль класса фрегат. Маскировка не спасла субмарину от подрыва на магнитной мине в проливе Убе. Лодка вернулась на ремонт в Курэ. Ложную надстройку перенесли на I-401, которая также вышла в Дайрен и также вернулась назад, поскольку проблема топлива в метрополии временно разрешилась.
11 мая 1945 г. две субмарины специального назначения вместе с лодками I-13 и I- 14 покинули военно-морскую базу Курэ, прошли проливом Кан-мон и вышли в Японское море, взяв курс на порт Майзуро в префектуре Киото. Майзуро был выбран в качестве главной базы 1-й эскадры подводных лодок. Планировалось, что к лодкам для совместных учений присоединятся три гидросамолета «Сейран».
Изначально объектом первой боевой операции 1-й эскадры подплава был означен док Гэтоун в Панамском канале. Разрушение дока неминуемо задержало бы переброску американского и британского флота из европейских вод, где война уже завершилась, на Тихий океан. Для атаки выделялось десять гидросамолетов «Сейран» под командованием лейтенанта Ацуши Асамуры, шесть вооруженных торпедами и четыре с бомбами. Экипажи «Сейранов» упражнялись в атаках построеного макета дока, каждый экипаж самым тщательным образом отрабатывал свою задачу, доводя ее выполнение до автоматизма. Уже был проложен курс. Эскадре предстояло пройти маршрутом адмирала Нагумо до Гавайских островов, оттуда – к берегам Колумбии, а уже вдоль побережья Колумбии субмарины спустились бы к Панамскому каналу. Запаса топлива двум лодкам типа AM для такого перехода не хватало, поэтому на маршруте предусматривалась их дозаправка от более крупных субмарин.
Драматическая атака, способная по мнению японского командования решить исход войны, не состоялась. Для Японии уже сложилась критическая ситуация – американцы вот-вот могли начать топтать своими ботинками прекрасные острова метрополии, а с севера на Сахалином и Хоккайдо уже завис грозный кирзовый сапог русскою солдата. В данной ситуации командование Императорским флотом приняло решение бросить все свои боеспособные силы против американского флота. Такой приказ, известный под номером 95, был отдай 25 июня 1945 г. Согласно приказу № 95 I -й эскадре предписывалось использовать все способные подняться в воздух «Сейраны» в самоубийственной атаке против американских авианосцев, стоявших на якорях у атолла Улити.