Иранские города один за другим переходили под власть Порты. Жители Багдада вышли навстречу Сулейману Великолепному и преподнесли ему ключи от города. 2 декабря 1534 г. султан торжественно въехал в Багдад.
Сулейман Великолепный 4 месяца пребывал в Ираке, занимаясь организацией управления «на самых справедливых основах». Первым делом он вернул суннитам их руководящее положение. По его приказанию были восстановлены суннитские святыни - мавзолеи Абд аль-Кадера аль-Гайлани и Абу Ханифы, мощи которого были обнаружены «чудесным образом», вызвавшим благоговейный трепет как турецких воинов, так и местного населения. К султану явился хранитель гробницы Абу Ханифы и под присягой заявил, что по повелению неба он спас мощи имама. Турецкие историки сообщают: «Послушный этому небесному предупреждению, он подменил тело блаженного Абу Ханифы телом какого-то неверного, а того перенес в укромное место». И вскоре самые благочестивые улемы, затем великий визирь и, наконец, сам Сулейман Великолепный удостоверились в правдивости этого рассказа. При огромное стечение народа султан лично спустился под своды каких-то развалин и «обнаружил» тело святого. Английский историк И. Хаммер писал: «Вся армия совершила паломничество к могиле имама».
Однако реставрация суннизма не сопровождалась религиозными репрессиями. Турки, как и везде, проявляли веротерпимость и оказывали внимание и покровительство как местным шиитам, так и евреям, и христианам. Даже езиды (огнепоклонники) первое время пользовались покровительством султана. Так, в 1534 г. глава езидской общины Хусейн-бек ад-Дасини получил от султана инвеституру на управление санджаком Эрбиль. Шииты сохранили свое внутреннее управление и полную свободу культа. Сулейман Великолепный посетил могилу знаменитого шиитского имама Муссы аль-Казыма и велел достроить его мавзолей, строительство которого началось еще при шахе Исмаиле. Затем султан совершил паломничество в Кербелу и Неджеф, а также пожаловал суннитским и шиитским святыням крупные вакфные имущества.
В апреле 1535 г. Сулейман Великолепный уехал из Ирака, оставив там 32-тысячную османскую армию, в том числе и тысячу мушкетеров-янычар. Вместе с ополчениями курдских и бедуинских князей это составляло внушительную силу. Теперь Ирак стал крупнейшим плацдармом турецкой военной мощи на Среднем Востоке.
Утверждение Порты в Центральном Ираке избавило Басру и Восточную Аравию от сюзеренитета Сефевидов. Но португальцы по-прежнему представляли большую опасность для этого региона, что вынудило его правителей поспешить с признанием своей покорности Порте. В Османской империи они видели единственного защитника их от бесчинств португальцев. В 1538 г. в Константинополь прибыло посольство правителя (хакима) Басры Рашида ибн Мугамиса с просьбой о принятии в османское подданство. Сулейман Великолепный согласился, осыпал милостями посла и назначил пожизненным правителем бассорских земель.
О переходе под власть Порты заявили также правители Лурестана, Хузестана, Бахрейна, Эль-Катифа и других княжеств Неджда и Нижнего Ефрата. Все они стали вассалами Порты, получили османские титулы и заверения в поддержке и покровительстве.
Первое время сюзеренитет Порты заключался в основном в чтении хутбы на имя турецкого султана и чеканке монеты с его именем. Изредка турки присылали оружие и строили форты, где размещали свои небольшие гарнизоны. Но со временем турецкое вмешательство во внутренние дела вассальных княжеств стало более явным. К тому же некоторые местные правители продолжали контактировать с португальцами, а также предоставляли убежище опальным османам. Это привело к серьезному конфликту между османскими властями и правителем Басры. Султан объявил Рашида ибн Мугамиса мятежником. Османские войска и речной флот под командованием наместника Багдада Айас-паши двинулись на Басру и быстро разбили ополчение мятежников, сожгли их флот и 15 декабря 1546 г. заняли Басру. Рашид ибн Мугамис с немногими верными ему людьми бежал в Эль-Хасу.
После этого Южный Ирак стал обычным эйалетом Османской империи. Айас-паша снизил налоги и упразднил многие поборы, взимаемые Рашидом ибн Мугамисом, ввел общеосманскую земельную и налоговую систему, обнародовал канун-наме Басры и бассорской таможни, приносившей немалые доходы от импорта индийских товаров. К 1551 г. процесс «османизации» Южного Ирака завершился.