В конце 1825 (или в начале 1826) года он составил записку, в которой писал, что в течение четырех лет проживая "в краю, столь щедро одаренном природою, с удивлением замечал, что вместо возрастающего благосостояния, бедность в народе, особенно между помещичьих крестьян, увеличивалась ежегодно…
Состояние крепостных крестьян наиболее обращает на себя отеческое попечение Вашего императорского величества. Сей полезный класс производителей, на которых основывается благосостояние государственное, обременен множеством налогов, падающих на лица и предметы первой потребности.
Власть помещика, на работу которого посвящает он половину жизни, выходя из границ человеколюбия, служит первым поводом к их разорению. Помещик сострадательный и образованный облегчает участь их, принимает меры для охранения их от бедности, помогает в плате подушной. Но это отнести должно к случаю и счастию малой части крестьян и едва ли найдется таких один на двадцать".
В своей записке Ф.П. Шаховской предлагал заменить подушную подать подоходным налогом, чтобы облегчить положение крестьян. Примечательны также его рассуждения о "капитале" применительно к крестьянскому хозяйству ("взимание подати с капиталов"); заложена и идея расширенного воспроизводства крестьянского хозяйства. В это же время он пересматривает свои взгляды и на другие вопросы русской жизни, например, каким путем пойдет дальнейшее развитие России. Но в следственном деле нет никаких данных о записке князя Ф.П. Шаховского, и некоторые исследователи предполагают, что записка эта, может быть, и не была отправлена царю и осталась лишь в черновом варианте.
Где застал князя день 14 декабря 1925 года — неизвестно, но присягу на верность императору Николаю I он принес в церкви своего села Ореховец. До него, конечно же, доходили слухи об арестах по всей России, и он не мог надеяться, что гроза пройдет мимо. Но прошел январь 1826 года, потом февраль, а его все не трогали, хотя имя его уже не раз звучало на допросах в Следственной комиссии.
А потом князь Ф.П. Шаховской сам явился к нижегородскому губернатору и просил быстрее отправить его в Санкт-Петербург, что и было сделано 3 марта. В Ореховце он оставил беременную жену и шестилетнего сына Дмитрия.
На допросах князь держался выдержанно: ни очные ставки, ни предъявленные показания арестованных членов "Союза благоденствия" не сбили его с намеченного пути зашиты. Его последние показания нисколько не дополнили тот материал, который следствие извлекло из его первых ответов. Показания Ф.П. Шаховского полны мужества и достоинства, которых так не хватало в признаниях и раскаяниях некоторых его товарищей.
В 1826 году князь был осужден Верховным судом по восьмому разряду, и в конце июля того же года его (и Заикина) в сопровождении фельдъегеря и четырех жандармов повезли в Сибирь. В октябре он прибыл в Туруханскин край, где много помогал местным крестьянам. Однако ссылка совершенно подточила здоровье князя, повлияла на его психику и умственные способности. "Нм овладела сильная религиозная экзальтация на нервной почве, выразившаяся в форме обоснованного на рационалистических началах протеста против господствующего вероисповедания".
Из Туруханска князя перевели сначала в Енисейск, а оттуда в 1829 году в суздальский Спасо-Евфимиев монастырь — "по причине помешательства в уме". 24 мая того же года он скончался. Было тогда князю Ф.П. Шаховскому всего 33 года; похоронили его на монастырском кладбище, находившемся за Никольской (больничной) церковью.
Через сто лет в газету "Правда" пришло письмо, в котором говорилось "о запущенном состоянии могилы Федора Петровича Шаховского". Исполнялось 100-летие со дня смерти декабриста, и вставал вопрос об увековечении его памяти. Но еще в 1924 году по распоряжению ОГПУ все надгробные памятники на могильном кладбище были снесены, и могила Ф.П. Шаховского, как и многие другие, затерялась. Сохранился только мраморный памятник, но уже без бронзового навершия, который Л.Д. Варганову удалось перевезти в музей. А еще есть его рукописная запись: "В 1940 году при строительных работах было вскрыто погребение Шаховского и освидетельствовано. Сохранность гроба и одежды исключительные. Шаховский в камзоле зеленого цвета, а сюртук темно-коричневый с бархатным воротником. Широкие суженные брюки темно-желтого цвета, заправленные в хромовые сапоги с короткими голенищами. На шее — кисейное жабо".
"Чешская страница" в истории Суздаля
После Октябрьской революции Спасо-Евфимиев монастырь закрыли, и до 1932 года в нем размещалась Суздальская тюрьма особого назначения (СТОН), которая оставила после себя до неузнаваемости перестроенные здания (особенно изнутри). В 1939 году, когда из обители выселили размещавшуюся там областную тракторную школу, в истории Спасо-Евфимиева монастыря открылась так называемая "чешская страница".