Антимендересовские настроения росли. В результате репрессий и ликвидации оппозиции создалась видимость спокойствия. Однако противники существующего режима не сложили оружия, они продолжали вести подрывную работу тайно. Особенно большую роль здесь играла Народно-республиканская партия, имевшая огромный опыт политической борьбы. Некоторые ее члены были ближайшими соратниками Ататюрка. Эта партия, в рядах которой было много представителей интеллигенции, оказывала сильное влияние на учащуюся молодежь. Многие из членов Народно-республиканской партии были представлены преподавателями высших учебных заведений, число которых в послевоенные годы увеличилось, а потому резко возросло и число студентов. Повысилась их политическая активность, изменился социальный состав. Наряду с детьми буржуазии, помещиков и городского мещанства в вузы пошли учиться и дети трудовой интеллигенции. Кроме того, на студенческих скамьях появились даже сыновья и дочери рабочих, крестьян и городской бедноты. Они-то и выступили первыми. Прежде всего студенческие волнения вспыхнули в Стамбуле. 27 апреля 1960 года студенты Стамбульского университета в знак протеста против массовых репрессий устроили митинг. На следующий день состоялась многотысячная демонстрация под лозунгами, требовавшими смены правительства, свободы и справедливости. В ответ на это Мендерес объявил военное положение и вызвал войска, но и в армии было немало сторонников Кемаля. Среди молодых офицеров задолго до студенческих демонстраций создавались тайные группы, ставившие задачу свержения правительства Мендереса.
Парламент был распущен, Демократическая партия ликвидирована, члены правительства арестованы, руководящие деятели и другие лица, заподозренные в финансовых злоупотреблениях, нанесших ущерб государству, заключены в тюрьму. Вся полнота власти фактически оказалась в руках военных. Джемаль Гюрсель, стал во главе государства и правительства. Но, следуя кемалистской традиции, Гюрсель осуществлял свою власть через вновь созданный Комитет национального единства (КНЕ), в который входили и гражданские лица. КНЕ назначил и Верховный суд, и Высшую следственную комиссию, которая начала расследовать преступления Мендереса и его группы. Подсудимых обвинили в неуважении к конституции и нарушении ее статей, преследовании членов Народно-республиканской партии, финансовых злоупотреблениях, использовании служебного положения в целях наживы. Судебный процесс проходил в неприступной военной тюрьме на острове Яссыада, в Мраморном море, куда были переброшены заключенные. По-видимому, заговорщики опасались эксцессов со стороны верующих.
Существует предположение, что Исмет-паша, отстраненный от дел Баяром и преследовавшийся Мендересом, не остался в стороне от заговора. Исмет Инёню с его регулярностью в армии (ведь он был начальником Генерального штаба при Кемале и лидером партии, подвергавшейся гонениям за кемализм), несомненно, сыграл в заговоре определенную роль. Этот человек поистине неотделим от истории республики.
Обвинительный акт суда над Мендересом касался только его внутренней политики. Внешняя же политика не обсуждалась, а КНЕ полностью ее одобрил, заявив, что в этой области не предвидится никаких перемен. Что же это была за политика?