В 1916 году Мустафа Кемаль был отправлен на Кавказский фронт, где он получил звание паши и чин генерала. В 1917 году Кемаль-паша назначается в Сирию на пост командующего армией, входившей в группу «Йылдырым» («Молния»), бывшую под началом германского генерала. Возмущенный немецким вмешательством в турецкие дела, он уезжает в Стамбул. Тогда же получает высокое придворное звание флигель-адъютанта султана и сопровождает наследного принца Вахидеддина в его поездке в Германию. Вскоре Кемаль вынужден был отправиться в Карловы Вары для лечения хронического заболевания желчных протоков.
В июле 1918 года умер султан Мехмед V, и на трон под именем Мехмеда VI вступил Вахидеддин.
Мировая война близилась к концу. 30 октября 1918 года было подписано Мудросское перемирие; немцам пришлось покинуть турецкую территорию. С ними ушли Энвер-паша и другие младотурецкие лидеры.
Конец войны застал Османскую державу на грани катастрофы. Страны-победительницы вели тайные переговоры о ее разделе. После безоговорочной капитуляции воинские подразделения, которыми командовал Кемаль-паша, вопреки его воле были распущены. Войска союзников наводнили Стамбул. Султан сформировал проанглийское правительство, в стране фактически хозяйничали победители. Парламент был разогнан. Султан больше всего заботился о сохранении своих титулов. Англичане заняли Урфу, Эскишехир, Кютахью, Мараш, Мерзифон, Антеп, Трабзон, Афьон-Карахисар и Самсун — районы, богатые нефтью и углем. Кроме того, они поддерживали армянских контрреволюционеров-дашнаков и под лозунгом «независимости» готовили восстание курдов. Итальянцы оккупировали Юго-Западную Анатолию, включая Конью. В Адане и Зонгулдаке расположились французы. 15 мая 1919 года в Измире высадились греческие войска.
Сторонники соглашательской политики в Стамбуле, примирившиеся с оккупацией, искали сильного покровителя, который обеспечил бы сохранение власти султана. Мустафа Кемаль решительно выступил против этой политики. В июле 1919 года он подает в отставку. Его опорой становятся возникающие в стране общества защиты прав и общества защиты прав восточных вилайетов. Из этих обществ вскоре образовалось Всетурецкое общество защиты прав Анатолии и Румелии. Народные представители этого Общества избрали Кемаля председателем конгресса в Эрзуруме. Одной из заслуг Мустафы Кемаля было то, что он в своей деятельности обращался к народу, помогал партизанским отрядам, особенно активно действовавшим в районе Измира, где они вели борьбу против греческой интервенции. Мустафа Кемаль вел разъяснительную работу в воинских частях с целью пробудить среди солдат чувство патриотизма и объединить в борьбе за независимость всех офицеров, свободных от фанатической преданности султанату и халифату.
Воззвания Мустафы несли людям новые идеи и новые понятия. Так, в воззвании от 22 июня 1919 года он писал: «Целостность страны, независимость народа в опасности... Только энергия и воля народа могут спасти нашу независимость».
Высокая Порта под давлением англичан слала одну за другой телеграммы, лишавшие Мустафу Кемаля полномочий и званий. Сторонников султана призывали не подчиняться «невменяемому» паше, а самого пашу тщетно пытались доставить в Стамбул.
Съезд обществ «защиты прав» не только восточных вилайетов, но и всей Турции в Сивасе в сентябре 1919 года укрепил положение Мустафы Кемаля. Он был избран председателем Представительного комитета Общества защиты прав. Принятый на этом конгрессе манифест к народу гласил: «Если центральное правительство не способно отстоять независимость народа и целостность государства, необходимо создать в этих целях временное правительство...». «Основная задача — передать власть в руки народа и его вооруженных сил».