Удивительна история и самого Покровского монастыря, и обретения им святых мощей Матроны Московской. Когда-то на месте монастыря были так называемые «Убогие дома» – а попросту братская могила, где хоронили всех, кто умер без покаяния. Это были как правило нищие, бездомные, другие безвестные люди, найденные мертвыми на улице, а также казненные преступники. Рассказывали, что именно здесь оказалось в свое время и тело самозванца Григория Отрепьева – Лжедмитрия, убитого восставшим народом.
В 1626 году на Покров день царем Михаилом Федоровичем Романовым вблизи Убогих домов был основан Покровский монастырь. Сами же Убогие дома прекратили свое существование при правлении Елизаветы II, дочери Петра I: тогда в России была отменена смертная казнь, а вместе с ней ушла в прошлое и традиция без разбору хоронить погибших и убиенных таким нецивилизованным способом. К тому же нагрянувшая эпидемия чумы сделала братские могилы опасным источником инфекции. Тогда они и закончили свое существование, и Елизавета распорядилась больше никого не хоронить в городской черте, устроив для этого кладбища за пределами Москвы.
Отстроен монастырь был лишь через двадцать лет после основания, уже при царе Алексее Михайловиче. Знал он и очень хорошие времена, когда цвели здесь фруктовые сады, сияли куполами церкви, и годы разрухи, и следующего за ними возрождения, пострадал во время войны 1812 года, после вновь был восстановлен, и еще не раз перестраивался. После революции 1917 года его постигла печальная участь большинства российских монастырей: обитель закрыли, с церквей сняли купола, и в обезображенных зданиях разместили какие-то учреждения и организации.
Лишь в 1994 году монастырь, до революции бывший мужским, был возобновлен, но теперь уже в качестве женской обители. Настоятельницей его стала инокиня Ольга (Мискина), в монашестве получившая имя Феофания. И все тяготы по восстановлению разоренного, изуродованного монастыря взяла она на себя вместе с первыми сестрами-насельницами. Денег не реставрацию не было, и, казалось, помочь могло только чудо. И Феофания знала, у кого просить о чуде. Конечно, у святой Матроны Московской. Стала она вместе с сестрами молиться на могиле Матронушки – тогда еще запущенной, мало кем посещаемой. И деньги находились – действительно чудом, приходили самыми неведомыми путями.
Так обрел монастырь свою небесную покровительницу. А когда поднялся монастырь из разрухи, мощи Матроны Московской были перенесены с Даниловского кладбища сюда, чтобы после канонизации святой стать его главной святыней.
Сегодня благодаря Матроне Московской Покровский монастырь стал самым посещаемым в Москве: сплошным потоком изо дня в день идут сюда люди, чтобы поклониться святым мощам праведницы и чудотворицы.