Отпевал Феодора Феодоровича в Спасо-Преображенской церкви города Темникова протоиерей Асинкрит Иванов, который за день до кончины праведника, в праздник Покрова Пресвятой Владычицы нашей Богородицы, принимал его последнюю исповедь и причащал Святых Тайн; когда гроб с телом усопшего адмирала, при большом стечении народа, был вынесен на руках из города, его хотели положить на подводу, но народ продолжал нести его до самой Санаксарской обители. Там встретила благоверного воина Феодора монастырская братия, Феодор Феодорович был погребен у стены соборного храма, рядом с родным ему преподобным Старцем, чтобы быть им отныне вместе навеки.
После праведной кончины Феодора Феодоровича прошло почти два столетия. Его подвижническая и высокодуховная жизнь, его добродетели не были забыты в родном Отечестве. Его заветами жили русские воины и флотоводцы, ученики и продолжатели его идей и идеалов преумножали славу русского флота.
Когда наступили времена гонений на Русскую Православную Церковь, Санаксарский монастырь, где упокоился Феодор Феодорович, был закрыт. Часовня, выстроенная над его могилой, была до основания разрушена, честные его останки в 1930-е годы были осквернены безбожниками.
В годы Великой Отечественной войны 1941–1945 годов воинская слава Феодора Феодоровича Ушакова была вспомянута, его имя, наряду с именами святых благоверных князей Александра Невского и Димитрия Донского, и великого русского полководца Александра Суворова, вдохновляло к подвигу защитников Родины. Были учреждены орден и медаль адмирала Ушакова, которые стали высшими наградами для воинов-моряков.
Отныне могила Феодора Ушакова и, как следствие, весь Санаксарский монастырь находились под присмотром государственной власти, и это предотвратило разрушение чтимой праведником обители.
В 1991 году Санаксарский монастырь был возвращен Русской Православной Церкви. Почитание святого праведника год от году возрастало. На его могиле служились панихиды, многочисленные паломники — духовенство, монашествующие, благочестивые миряне, среди которых часто можно было видеть воинов-моряков, — приходили поклониться Феодору Феодоровичу Ушакову, светлый облик которого оказался необычайно близок и воинству, и народу, побуждая к столь же ревностному служению военному и гражданскому, «дабы увидеть новую славу любезного Отечества».
Синодальная комиссия по канонизации святых Русской Православной Церкви, внимательно изучив его подвижнические труды в служении Отечеству, благочестивую жизнь, праведность, милосердие и самоотверженный подвиг благотворительности, не нашла препятствий к канонизации, и в декабре 2000 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II благословил прославить адмирала Российского флота Феодора Ушакова в лике праведных местночтимых святых Саранской епархии.
Российский флот, боголюбивое Российское воинство обрели небесного предстателя и ходатая перед Престолом Божиим о многострадальном Отечестве нашем.
Святые мощи праведного воина Феодора Ушакова находятся в соборном храме Рождества Богородицы.
Память святому праведному воину Феодору Ушакову празднуется в день его прославления — 23 июля/5 августа, а также в день его блаженной кончины — 2/15 октября.
На Малой вечерни
От благочестиваго корене святолепная розга произшед,/ плод произнесе любве и правды,/ премирно благоухая верно от души чтущыя тя,/ о нихже со Ангелы Христу молися, Феодоре,// даровати мир и велию милость.
Преславное твое житие/ и подвизи велии, иже на мори,/ всюду предивна тя показаша,/ праведников благолепие, воевод похвало:/ и, яко солнце, на земли лучи распростер, озарил еси верных сердца,/ совершающих Божественную твою память,// всехвальне Феодоре.
Благочестием и верою светло украшен,/ яко мужествен воин, и преизряден, и преименит,/ Православнаго Отечества поборник был еси:/ от негоже ныне ублажаемь,// моли даровати нам мир и велию милость.
Тирона и Стратилата храбрости подражая,/ изволил еси братися за люди Божии,/ темже и на злочестивых агарян на-шед,/ невредимь пребыл еси,/ славу Отечеству твоему принося./ Ныне убо со святыми пребывая,// мирное житие у Господа испроси наследию твоему.
Приидите, вернии, в честную обитель Санаксарскую,/ велицыи и малии,/ восхвалим теплаго предстателя и ходатая,/ Христова воина и молитвенника,// праведнаго Феодора.
Радуйся, Богородице Дево,/ радуйся, похвало всея вселенныя,/ радуйся, Пречистая Мати Божия, Благословенная.
Дом добродетелей Святаго Духа/ поспешением благодати/ Феодор явися:/ Темже ныне сошедшеся,// Тому воспоим.