Генрих Мюллер родился в 1900 году в крестьянской католической семье в земле Бавария. Его отец служил в жандармерии, так что с основами полицейской службы Генрих познакомился еще дома. В его внешности не было ничего выдающегося — невысокого роста, плотный, с массивной, почти квадратной формы головой. Темные внимательные глаза, которые, казалось, прощупывали человека насквозь. Внешность более, чем заурядная. Но были у него черты характера, очень нужные новым немецким властям: работоспособность, умение четко отслеживать события и въедливо следовать букве предписания или инструкции. Он раньше всех появлялся в своем кабинете и уходил последним. Нелады в семье, раздоры с женой вынуждали его проводить все свободное время на службе. Особого образования он не получил, с юности пошел в работать на авиазавод, потом отправился добровольцем на войну и после увольнения в звании унтер-офицера в 1919 году решил служить в полиции Мюнхена. Боролся против коммунистов, против социал-демократов и даже против нацистов в начальной стадии. Он впитал в себя не лучшие черты полицейского администратора — грубость, упрямство и безоговорочное почитание начальства. В мюнхенской полиции он оставался до тех пор, пока на него не обратил внимание Гиммлер. По его совету в 1934 году Мюллер вступает в ряды эсэсовцев и покидает Мюнхен. Его переводят с повышением в Берлин, ему предлагают пост заместителя руководителя службы политической тайной полиции. Официально руководителем гестапо он становится с 1939 года, но в проведении различного рода политических разоблачений и операций принимал участие со времени своего переезда в Берлин.
Так, 12 января 1938 года центральные берлинские газеты поместили сообщение о том, что военный министр в правительстве Гитлера фельдмаршал Вернер фон Бломберг, который, собственно, и создавал германские вооруженные силы — вермахт, сочетался законным браком с фройляйн Грун, по имени Ева. В этом традиционном анонсе не было ничего необычного, кроме двух скрытых моментов: во-первых, самому военному министру, вдовцу и отцу взрослых детей, было шестьдесят лет, возраст уже достаточно почтенный, скорее, пенсионный, а вот его невесте исполнилось всего… 24 года. Подобного рода браки в нацистской Германии не особо приветствовались, но в церемонии этого бракосочетания в качестве свидетелей участвовали Адольф Гитлер и Герман Геринг — первые лица в государстве.