Даниловское село. Вперед, март 1875.
Из-за решетки. Сборник стихотворений русских заключенных. Женева: Работник, 1877.
Разные известия. Земля и воля, 1878, № 1.
Хроника арестов. Земля и воля, 1878, № 2.
Убийство шпиона Рейнштейна. Листок «Земли и воли», 1879, № 1.
Фомин. Листок «Земли и воли», 1879, № 1, 2.
По поводу политических убийств. Листок «Земли и воли», 1879, № 2.
Февральские аресты в Петербурге. Листок «Земли и воли», 1879, № 2, 3.
Передовые статьи. Листок «Земли и воли», 1879, № 1, 2.
Суд над Бобоховым. Листок «Земли и воли», 1879, № 2, 3.
Киевские события. Листок «Земли и воли», 1879, № 5.
Дело братьев Избицких в Киеве. Листок «Земли и воли», 1879, № 6.
Хроника военного положения. Листок «Земли и воли», 1879, № 6.
Урюпинское дело. Листок «Земли и воли», 1879, № 6.
Суд над Дубровиным. Листок «Земли и воли», 1879, № 5.
Хроника преследования. Народная воля 1879, № I, – 1880, № 3.
Попытка освобождения Войнаральского. Земля и воля, 1879, № 4.
От исполнительного комитета. Листок «Земли и воли», 1879, № 1, 2, 3, 4, 5, 6.
От Исполнительного комитета. Народная воля, 1879, № 1, 3.
Террористическая борьба. Лондон: Русская типография, 1880.
Стихотворения (1875–1880). Женева: Типография Работника и Громады, 1880.
Из стен неволи. Сборник стихотворений. Ростов н/Д.: Донская речь, 1906.
Периодические системы строения вещества. Теория образования химических элементов. М.: Сытин, 1907.
Откровение в грозе и буре. История возникновения Апокалипсиса. СПб.: Былое, 1907.
Д. И. Менделеев и периодическая система химических элементов. СПб.: Изв. СПБ. биол. лаб., т. 8, вып. 3, 1907.
Теоретический вывод периодической системы современных химических элементов. СПб.: Изв. СПб. биол. лаб., т. 8, вып. 4, 1907.
Андрей Франжоли. Былое, 1907, № 3.
Эры жизни. Научная полуфантазия. Современный мир, 1907, № 1.
Основы качественного физико-математического анализа и новые физические факторы, обнаруживаемые им в различных явлениях природы. М.: Сытин, 1908.
Д. И. Менделеев и значение его периодической системы для химии будущего. М.: Сытин, 1908.
Свидание с Толстым. Русские ведомости, 1908, № 229.
Почему мы не рассыпаемся? Современный мир, 1908, № 12.
Законы сопротивления упругой среды движущимся в ней телам. СПб.: Т-во художественной печати, 1908.
Вновь открытые превращения эманаций радия с точки зрения эволюционной теории строения атома. СПб.: Изв. СПб. биол. лаб., т. 9, вып. 3. – 1908.
В поисках философского камня. СПб.: Общественная польза, 1909.
Начала векториальной алгебры в их генезисе из чистой математики. СПб.: Общественная польза, 1909. Атомы души. Современный мир, 1909, № 11.
Письма из Шлиссельбургской крепости. СПб.: Аверьянов, 1910.
Звездные песни. М.: Скорпион, 1910.
На границе неведомого. М.: Звено, 1910.
Эволюция вещества на небесных светилах по данным спектрального анализа. М.: Тип. Моск. унив-та, 1910.
Что может принести нам встреча с кометой. М.: Сытин, 1910.
Вселенная. В кн.: Итоги науки в теории и практике, т. 2. М.: Мир, 1911.
По поводу авиационных катастроф. Речь, 1911, № 190.
Природа и математика. В кн.: Ф. Л. Кольрауш. Введение в дифференциальное и интегральное исчисление и дифф. уравнения. СПб.: Общеcтвенная польза, 1911.
Свободный полет на воздушном шаре. Русская мысль, 1911, № 2.
Звездные рои. Известия русского общества любителей мироведения, 1912, № 1.
Солнечное затмение 4(17) апреля 1912 года Полет на аэростате во время затмения. Известия русского общества любителей мироведения, 1912, № 2.
Поэзия в науке и наука в поэзии. Русские ведомости, 1912, № 1.
Прошедшее и будущее миров с современной геофизической и астрофизической точки зрения. Природа, 1912, № 3.
Функция. СПб. – Киев: Сотрудник, 1912.
Пророки. М.: Сытин, 1914.
Повести моей жизни. Т. I. М.: Задруга, 1916.
Как прекратить вздорожание жизни. М.: Сытин, 1916.
Завоевание воздуха. В кн.: Итоги науки в теории и практике. М.: Миру 1916.
Эволюционная социология, земля и труд. Пг.: Свет и свобода, 1917.
Революция и эволюция. Пг.: Копейка, 1917.
Наука и свобода. Природа, 1917, № 5–6.
Семь дней революции. События в Москве. Дневник очевидца. М., 1917.
Повести моей жизни. Т. 2, 3, 4. Задруга, 1918.
Принцип относительности и абсолютное. Пг.: Госиздат, 1920.
Звездные песни. Кн. 1–2. Задруга, 1920.
Принцип относительности в природе и математике. Пг.: Начатки знаний, 1922.
Христос. Т. I. Л.: Госиздат, 1924.
Среди облаков. Л.: Путь к знанию, 1924.
Поезд сознания. Человек и природа, 1924, № 7–8.
Христос. Т. 2. Л.: Госиздат, 1926.
Христос. Т. 3. М. – Л Госиздат, 1927.
Христос. Т. 4. М. – Л. Госиздат, 1928.
Христос. Т. 5. М. – Л. Госиздат, 1929.
Христос. Т. 6. М. – Л. Госиздат, 1930.
Христос. Т. 7. М. – Л. Госиздат, 1932.
Повести моей жизни. Т. 1, 2, 3. М.: Изд-во политкаторжан, 1933.
Факторы биологической эволюции. Л.: Изв. науч. ив-та им. П. Ф. Лесгафта, Т. 19, вып. 1, 1936.
Повести моей жизни. Т. 1, 2, 3. М.: АН СССР, 1947.
Повести моей жизни. Т. 1, 2. М.: АН СССР, 1961.
Повести моей жизни. Т. 1, 2. М.: АН СССР, 1962.
Лунные кратеры и цирки. Техника молодежи, 1963, № 7, 8.