Аллан Кардек утверждал также, что некоторые заболевания вызываются духовными причинами — особенно эпилепсия, шизофрения и раздвоение личности. От таких недугов вполне можно избавиться посредством лечения психики под духовным руководством. Такие идеи были особенно распространены в спиритуалистическом сообществе, где медиумы обращались к миру духов, чтобы помочь страждущим избавиться от разных заболеваний.
В то же время утверждение Кардека о необходимости перевоплощения так или иначе выводило спиритуалистические доктрины за рамки доказательства жизни после смерти. Фактически «законодатель» настолько уверился в своей правоте, что совершенно исключил из практики исследований любые физические проявления, кроме автоматического письма, которое, как он считал, было менее подвержено влияниям предвзятых мнений. Дело в том, что настоящие спириты рассматривают стуки, верчение столов, парение в воздухе и «материализации» просто как комнатные игры, хотя в ироническом смысле сторонники учения часто используют слово «спиритизм» для обозначения производства физических феноменов. Вследствие этого исследования психического феномена во Франции, например, почти на 20 лет отставали от аналогичных исследований в других частях Европы.
Были критики спиритизма и внутри спиритуалистических обществ, в частности в Великобритании и Соединенных Штатах. Они утверждали, что если бы перевоплощение действительно имело место, то духи, с которыми устанавливали контакт медиумы, обсуждали бы эту тему, тогда как в действительности они этим не занимаются.
Согласно спиритическому учению, страдания и болезни в этой жизни — результаты духовного влияния, являющегося отзвуком беспорядочной жизни индивида в прошлом. Каждый раз, когда душа перерождается, по мнению Кардека, она несет с собой в качестве «подсистем» прошлые жизни, которые даже могут в общих чертах предопределить реальность нынешней жизни. Каждое перерождение, каким бы болезненным оно ни было, согласно Кардеку, позволяет душе усовершенствоваться и в конечном счете достичь более высокого плана существования.
Кардек считал, что личность состоит из трех частей: воплощенной души, тела и «перидуха», или того, что Кардек описывал как полуматериальную субстанцию, которая объединяет душу и тело и окутывает их подобно оболочке. Все души создаются равными, несведущими и неиспытанными, и они продолжают возвращаться к жизни до тех пор, пока не остается ничего, чему они могли бы научиться.
В момент смерти физического тела «перидух» удерживает душу и отделяется от тела. Этот процесс бывает более длительным, если умерший был сильно привязан к своему материальному существованию. Духовно продвинутые души, писал Кардек, встречают смерть с радостью, как если бы она обозначала освобождение и обещание будущего просветления.
С другой стороны, духи тех несчастных, которые умерли внезапно или насильственной смертью, отчаянно цепляются за свои материальные тела, пребывая в замешательстве и будучи уверенными, что они не умерли. Особенно это характерно для самоубийц, которые могут перевоплотиться лишь для того, чтобы снова покончить с собой. Только когда «перидух» оставляет плоть, полагал Кардек, душа по-настоящему понимает, что она более не является частью человеческого мира.
Когда «перидух» покидает тело, душа возвращается в духовный мир, где, по мнению спиритов, рассматривает свои прошлые жизни и свое продвижение к просветлению и решает, каким жизненным путем ей следует идти далее. Каждая душа имеет полную свободу в выборе своей следующей жизни и часто возвращается к своему земному воплощению. В тех случаях, когда два духа желают занять одно и то же тело, выбор делает Бог или, по характеристике Кардека, Высший Разум и Первопричина Всех Вещей.
Духи, которые пережили на земле нечеловеческие страдания, согласно другому писателю-спириту Андре Луи, решают посвятить себя «духовному вампиризму». Кардек, однако, не считал всякую одержимость преднамеренной. Духовное вторжение имеет место, когда душа недавно умершего входит в живого человека, полагая, что смерти не было. Кардек отрицал, что изгнание нечистой силы может быть совершено посторонним человеком, будь то во имя Господа или нет. Он утверждал, что одержимый должен совершать экзорцизм (процедура изгнания бесов) посредством убеждения и молитвы, соглашаясь с поговоркой, что «Бог помогает тем, кто помогает себе сам».