После завершения перестроечных работ и отделки внутренних помещений четырехэтажного флигеля в нем первоначально поселились оба наследника основателя торговой фирмы со своими семьями. Однако в начале 60-х годов XIX столетия, после согласованного раздела унаследованной от отца недвижимости, комплекс зданий, расположенных на набережной реки Мойки, Невском проспекте и Большой Морской улице, переходит в собственность старшего брата – Степана Петровича Елисеева, прожившего на набережной реки Мойки до своей смерти в 1879 году. Комплекс же домов в Центральном районе Петербурга унаследовал его единственный сын – Петр Степанович Елисеев, вышедший через два года из семейного Торгового дома братьев Елисеевых и посвятивший себя карьере финансиста. С 1881 года Петр Степанович становится одним из ответственных руководителей Русского внешнеторгового банка. Так же, как и его родитель, сын активно занимался благотворительностью. Свою дочь, Анну Петровну, банкир выдал замуж за богатого купца столицы конца XIX – начала XX столетий, коммерсанта и общественного деятеля Павла Ивановича Лелянова. Потомственный почетный гражданин, купец 1-й гильдии, жених в ранге городского головы возглавлял городское самоуправление вплоть до событий Февральской буржуазной революции 1917 года.
В 1901 году банкир Петр Степанович Елисеев скончался. Его недвижимость, включая семейный дом № 59 на набережной реки Мойки, переходит по наследству внуку Степана Петровича, названного при крещении в честь своего достославного деда.
При этом Степан Петрович Елисеев в 1902 году по проекту зодчего Александра Карловича Гаммерштедта произвел новый основательный ремонт семейного особняка. Этот проект включал не только фасадные работы, но и значительный перечень перестройки убранства интерьеров особняка. Парадный вход в дом устроили в самом дальнем от Невского проспекта участке набережной Мойки. Вход в здание зодчий украсил кованым металлическим козырьком и изящно оборудовал представительным резным дубовым тамбуром. Парадную дверь украшали вырезанная из дерева массивная монограмма «СПЕ» (Степан Петрович Елисеев) и цветные витражи с гравировкой. Гостей дома восхищала дорогостоящая внутренняя отделка комнат особняка редкими сортами облицовочных материалов.
Стены парадного вестибюля украшали массивные резные дубовые панели и красивый камин, облицованный редким коричневым полированным мрамором. Потолок вестибюля художники оригинально декорировали орнаментальной росписью. С этим великолепием удивительно изящно сочеталась парадная лестница с мраморными ступенями, стенами, украшенными лепкой и росписью по штукатурке.
Помещения первого этажа семейного дома Елисеевых на Мойке сдавались в аренду. Личные же покои владельцев особняка располагались на втором и третьем этажах. Комнаты декорировались художниками, использующими мотивы самых разных исторических времен и стилей.
Приемную устроили в стиле Людовика XVI, рабочий кабинет главы семейства – в стиле французского ампира, парадный зал особняка – в духе барокко, гостиную и будуар супруги выполнили в манере рококо, а помещение столовой – в жанре ренессанса. Отделка помещения библиотеки и спальни зодчим Гаммерштедтом оригинально решена приемами модного в те годы стиля модерн. При отделке внутренних помещений семейного особняка архитектор использовал наиболее дорогие и ценные породы дерева, цветного мрамора редких сортов, кованый металл, бронзу и уникальные цветные витражи. При этом к отделочным работам привлекались исключительно самые известные мастера и фирмы России, Франции, Великобритании. Убранство внутренних покоев дома на Мойке дополнялось уникальной коллекцией произведений французского ваятеля Огюста Родена, собранной сыном основателем Торгового дома Елисеевых Степаном Петровичем.
В 1916 году столичный справочник «Весь Петербург» опубликовал сведения о том, что «в доме со стороны Мойки живут сын и внук покойного Петра Степановича – Степан Петрович и Петр Степанович Елисеевы, потомственные дворяне, члены правления страхового общества „Русский Ллойд“, а также Русского для винной торговли и Торгово-промышленного банков, расположенных на Морской улице…». Данная справка довольно красноречиво свидетельствует, что потомки Степана Петровича Елисеева, вышедшие из семейного Торгового дома Елисеевых, состояли одновременно членами совета Торговой школы и, таким образом, не забывали о торговых делах, возвеличивших некогда их знаменитых предков.
Два последовавших друг за другом государственных переворота 1917 года и сопутствующее им революционное лихолетье не только потрясли основы Российской империи, но и привели к неизбежным драматическим последствиям в жизненном укладе и работе россиян. Все попытки русских предпринимателей найти общий язык с новой властью оказались безрезультатными. Нарастающий поток репрессий и произвола в огромной стране заставлял различных представителей населения бывшей имперской столицы, не нашедших свое место в новом обществе, покинуть родину.