По результатам испытаний машины № 1 танк ИС-7 был рекомендован на министерские испытания с внесением в его конструкцию некоторых изменений.
В1948 г. на машине № 1 проводились разнообразные работы — например, снятие виброграмм, зимний пуск двигателя, определение обзорности прибора ТКСП-2 и т. д. За это время (по сентябрь включительно) машина № 1 прошла 152 км, двигатель отработал 18 ч 20 мин. Всего двигатель на машине бессменно отработал 157 ч 31 мин.
В период с 28 сентября по 15 ноября 1948 г. сотрудники лаборатории № 10 филиала Опытного завода № 100 провели испытания экспериментальных образцов электроприводов наводки основного оружия конструкции ВЭИ МЭП. Для этого аппаратуру и узлы электропривода установили в машине вместе с механизмом поворота башни и подъемным механизмом пушки конструкции НИИАВ MB. Испытания проводились как для горизонтального положения танка, так для положения его на горках с углами подъема 5,10 и 15".
В декабре 1948 г. машина № 1 с комплектом электроприводов конструкции ВЭИ МЭП была предъявлена межведомственной комиссии, состоявшей из представителей Министерств транспортного машиностроения, электропромышленности, НТК ВТ и MB ВС, ВЭИ МЭП, военной приемки ЛКЗ и филиала Опытного завода N9100. Испытания прошли в период с 30 декабря 1948 г. по 8 января 1949 г. и продемонстрировали надежную работу электроприводов и полное их соответствие заданным ТТТ.
Второй образец танка ИС-7 (машина № 2) изготовили 6 октября 1947 г. (корпус и башня машины поступили на ЛКЗ с Ижорского завода 25 августа 1947 г., масса корпуса составляла 24167 кг, башни — 11801 кг). При сборке машины № 2 были учтены дефекты, выявленные при испытаниях машины № 1, что потребовало внесения изменений в конструкцию ряда узлов.
В период подготовки машины № 2 (без башни) к министерским испытаниям (в соответствии с приказом министра транспортного машиностроения № 254 от 29 октября 1947 г.) на заводских контрольных и обкаточных испытаниях она преодолела 320 км.
На министерские испытания машина № 2 была предъявлена 23 ноября 1947 г. Испытания состоялись на ЛКЗ в период с 23 ноября 1947 г. по 20 марта 1948 г. и проводились по специальной расширенный программе, включавшей испытания вооружения, средств внутренней и внешней связи и специальные динамические испытания. Однако в связи с необходимостью проверки ходовыми испытаниями ряда внесенных заводом изменений в конструкцию машины, первоначально намеченный пробег в 1000 км увеличили до 2000 км.
В ходе министерских испытаний в период с 23 ноября по 29 декабря 1947 г. машина № 2 прошла 737 км, из них по дорогам с твердым покрытием — 184 км, по местности и колонным путям со снежным покровом до 300 мм — 553 км. За это время были проведены все основные испытания, предусмотренные специальной программой (вооружения, средств внутренней и внешней связи и специальные динамические испытания). Одновременно машина № 2 прошла проверку на преодоление подъемов, спусков и кренов. Всего за 1947 г. танк ИС-7 (машина № 2) преодолел 1059 км.
В периоде января по 20 марта 1948 г. состоялись дополнительные министерские ходовые испытания машины-для проверки работы отдельных узлов и агрегатов. Они проводились на дорогах с твердым покрытием — по асфальтированному шоссе со снежным покровом различной толщины и плотности и на грунте — колонных путях, проложенных по снежной целине и местности со снежным покровом различной толщины.
Среднее значение максимальной скорости танка, полученное в процессе испытаний, составляло 59 км/ч, расход топлива на 100 км движения по асфальтовому шоссе достигал 419 л. Машина имела минимальный радиус поворота 5,25 м. Разгон с третьей до четвертой передачи осуществлялся за 40 с при пути — 238 м, торможение машины при движении на восьмой передаче осуществлялось за 14 с при тормозном пути 56,8 м.
Испытания пушки С-70 в ходе проведения министерских испытаний не проводились.
За это время машина № 2 прошла 1278 км, в том числе по дорогам с твердым покрытиям — 965 км и по колонному пути и местности — 313 км. Всего машиной № 2 на министерских испытаниях (с пробегами 1947 г.) было пройдено 2015 км, в том числе по шоссе — 1154 км и по колонному пути — 861 км. Двигатель за время министерских испытаний отработал 120 ч, в том числе 92 ч под нагрузкой, а общая наработка двигателя (с учетом заводских испытаний и стационаров) составила 163 ч.
Все агрегаты и механизмы танка в процессе испытаний работали удовлетворительно. Серьезных поломок и крупных дефектов не было.
Несмотря на удачную форму корпуса, башни и большую толщину основных броневых листов корпуса, мощное вооружение и удовлетворительную подвижность, наличие отдельных недостатков (особенно неудобства работы при эксплуатации и обслуживании) значительно снижало положительные качества машины.