Однако восстановительные работы поначалу не заладились. Уже 8 июля директор ГАЗа И.К. Лоскутов в письме начальнику облуправления НКВД В.С. Рясному отмечал
Таким образом, выполнение плана поставок составило лишь 23 %. Особые трудности представлял ремонт электрооборудования. Руководству завода пришлось организовать новые цеха, укомплектовать их малоквалифицированной рабочей силой и приступить к выпуску сложной электроаппаратуры и электроремонту. Из-за отсутствия специалистов, нехватки шарикоподшипников и роликоподшипников работы шли очень медленно и некачественно. В итоге план по ремонту электрооборудования был исполнен лишь на 27 %.
Несмотря на то что с момента первых разрушений прошел почти месяц, руководство «Стройгаза» не развернуло подготовительные и восстановительные работы в темпах, обеспечивающих выполнение решений Государственного и Городского комитетов обороны. Согласно постановлениям, трест должен был развернуть работы сразу на 24 объектах, однако руководство ОСМЧ считало первоочередными объектами лишь пять (механосборочный и литейный корпуса, колесный и прессово-кузовной цеха и главный магазин смежных деталей), а подготовительные работы, которые шли совершенно неудовлетворительно, в основном вело в механосборочном и литейном корпусах и колесном цехе. Часть работ была начата 30 июня – 1 июля (по цехам № 5, 8, прессово-кузовному и ТЭЦ). В общей сложности на 1 июля в распоряжении треста и его субподрядчиков имелись 9756 человек рабочей силы.
В литейном корпусе нужно было установить 47 ферм, но фактически к началу июля успели смонтировать только пять (участок № 1). Из 15 400 квадратных метров кровли было сделано 4640. Особые трудности представляла расчистка завалов на площади 13 000 квадратных метров в механосборочном корпусе. К началу июля ее удалось выполнить менее чем на треть. Разрушенную кровлю корпуса площадью 62 500 квадратных метров только начали ремонтировать, сделав 2700 квадратных метров. Были установлены всего 24 из 528 прогонов, демонтированы 272 металлоконструкции из 600.
Организация работ находилась на низком уровне: отмечались самовольные уходы и простои. Так, 27 июня в колесном цехе на участке плотничных работ из 14 рабочих фактически работало четверо. Работы в цехе еще только начинались, хотя он лежал в руинах уже три недели. Рабочий день формально составлял 12 часов, однако строительство было слабо обеспечено сварочными аппаратами, инструментом для газорезки, не хватало лебедок, рукавиц и костюмов. Для огромной массы людей, привлеченных для восстановления, не хватало самых элементарных вещей: столов, табуреток, кипятильников, бачков для воды и кружек. Часть рабочих на участке № 1 работала вообще разутыми.
Директору ГАЗа Лоскутову приходилось постоянно констатировать срыв поставок и нарушение графиков работ. В отчаянии он буквально завалил письмами начальника областного управления НКВД Рясного.