В течение этих одиннадцати мирных лет внутренняя деятельность нации развернулась во всех направлениях, и за это время приходится констатировать новый материальный и духовный прогресс. Старинные производства — часовое, ткацкое, хлопчатобумажное, шелковое, швейное — снова испытывали подъем. Однако торговля стала страдать от последствий континентальной блокады, которую Наполеон навязал всем своим союзникам, особенно с 1809 года. Издан был приказ сжечь на площадях английские товары и обложить колониальные продукты пошлиной в 40 процентов продажной стоимости. Вздорожание припасов и недостаток предметов первой необходимости вскоре вызвали всеобщее недовольство.
Филантропы не унывали. В 1810 году Каспар Гиртцель основал Швейцарский союз общественной пользы. С 1803 года его земляк, цюрихский гражданин Эшер, начал прорытие Линтского канала для урегулирования борьбы с наводнениями, которые до этого времени разоряли страну, орошаемую озерами Валленским и Цюрихским. Песталоцци продолжал свое педагогическое дело. Занимаясь им последовательно в Нейгофе, в Станце, в Берту, он в 1805 году окончательно перенес свой институт в замок Ивердон. Уроженец Берна, Фелленберг основал свое сельскохозяйственное заведение в Гофвиле, и кантональные правительства оказывали свое покровительство этим разнообразным школам, которые создали такую блестящую репутацию швейцарской школьной системе. Изучение самой территории деятельно двинулось вперед; в 1810 году начаты были триангуляционные измерения поверхности страны; изданы были замечательные географические карты. Иоганн фон Мюллер. продолжал свою национальную историю, а Г. Цшокке принялся за составление своей. С успехом культивировалась поэзия и намечалось литературное движение.
Хотя Женева считалась в то время частью Французской империи, все-таки ее образованное общество заслуживает упоминания в этом месте. Работавший в старинной женевской академии, славившейся во все времена, физик Марк-Огюст Пикте являлся достойным преемником естествоиспытателя Гораса-Бенедикта Соссюра. Женевское общество находилось под влиянием г-жи де Сталь, которая часто жила на ваадтской территории, в своем замке Коппе, где вокруг нее собирались: публицист Бенжамен Констан, историк Сисмонди, бернский философ Бонштеттен, немецкий критик Шлегель, виконт Матьё де Монморанси, женевский префект Барант. В 1810 году изгнание г-жи де Сталь привело к распадению этого выдающегося кружка, отдельные члены которого не переставали оказывать сильное литературное и политическое влияние во всем мире и особенно во Франции.
Внешние отношения; территориальные изменения. Снова считаясь независимым государством, Швейцария завязала опять дипломатические отношения с соседними странами, в том числе и с Австрией. Ей особенно приходилось договариваться с южно-германскими государствами благодаря территориальным изменениям, которые были вызваны постановлением Регенсбургского сейма, созванного после подписания Люневильского договора, и позднее статьями Пресбург-ского мира. Приходилось хлопотать о соответственных компенсациях и о вознаграждении, которые являлись последствием германских секуляризации. Швейцария вела переговоры с великим герцогством Ваденским и в 1812 году заключила с этим государством торговый договор.
Наполеон откровенно заявил, что Швейцария должна остаться под его опекой. 27 сентября 1803 года был подписан новый союзный договор между Францией и Швейцарией, но с тем ограничением, что этот союз будет только оборонительным, а не наступательным, как во времена Гельветической республики. Договор напоминал вечный мир 1516 года и заключался на пятьдесят лет. Франция гарантировала независимость Швейцарии и ее нейтралитет; в свою очередь Швейцария обязывалась посылать своей союзнице в случае необходимости вспомогательный отряд в 8000 человек, независимо от войск, какие она обязывалась доставлять ей на основании условий военного соглашения. Кантонам были предоставлены некоторые льготы в приобретении из Франции соли и других съестных припасов; поднимался также вопрос об открытии переговоров о торговом договоре, которого очень желали в Швейцарии.