В отношении действий старшего помощника командира С-56 В.Петрова капитан 2-го ранга Л.Хоменко показал, что старпом вместо того, чтобы повернуть вправо и дать турбинами ход назад, замешкался в кризисный момент с выяснением обстановки, в результате чего упустил драгоценное время, а затем принял неверное решение. (Впоследствии старший помощник
В.Петров, по имеющимся свидетельствам, сокрушался, что сам не может понять, как в той ситуации из нескольких возможных команд выбрал самую неприемлемую). Это была уже последняя, роковая ошибка. До этого, как показало расследование причин трагического инцидента, было невыполнение Международных Правил по Предупреждению Столкновений Судов в море (МППСС), которые распространяются и на подводные лодки, идущие в надводном положении, выключенная на 28 минут радиолокационная станция на подводной лодке в тумане, ночью, низкая организация дежурно-вахтенной службы, беспечность. В той ситуации подводная лодка должна была уступить «дорогу», подождать, пока пройдет судно «Академик Берг». В свою очередь на судне, видя, что этого не происходит и лодка продолжает опасно маневрировать по курсу, обязаны были хотя бы застопорить ход и дать предупреждение световыми сигналами. Ничего этого сделано не было. А ссылка капитана судна на то, что их РЛС подводную лодку не обнаружила и они думали, что это катер, выглядит, по меньшей мере, неубедительно, так как размеры цели «подводная лодка» и «катер» явно несоизмеримы. Беспечность была проявлена и с той, и с другой стороны…
19 июня 1973 года на кладбище поселка Тихоокеанский похоронили погибших подводников. Министр Обороны СССР маршал А.Гречко не дал «Добро!» на привлечение к уголовной ответственности офицера В.Петрова, в связи с чем автоматически освобождалось от ответственности и гражданское лицо – С.Куксенко, которые в момент столкновения несли командирскую и капитанскую вахту соответственно. Произошло это, по ряду свидетельств, из-за нежелания огласки случившегося, где вина флота в лице старпома подводной лодки В.Петрова просматривалась довольно основательно. С Министром Обороны был солидарен и главком ВМФ СССР адмирал С.Горшков – не надо никого судить, пусть эта трагедия послужит всем памятным горьким уроком.
С июня 1973 года по 19 февраль 1974 года подводная лодка прошла аварийно-восстановительный ремонт на ДВЗ «Звезда». 14 июля 1977 года в полигоне БП на глубине около 100 метров произошло разрушение бандажа обмотки носового якоря турбогенератора правого борта и выброс пламени в отсек, вызвавший незначительную задымленность.
Подводная лодка всплыла в надводное положение, турбогенератор правого борта был отключен, отсек провентилирован в атмосферу. 23 июля 1977 года С-56 выполнила ракетную стрельбу двумя ракетами за одно всплытие с оценкой «Отлично». 25 июля 1977 года переквалифицирована в БПЛ. В июле 1977 года завоевала приз ГК ВМФ и первое место в ВМФ по ракетной подготовке. В 1977 году была установлена негерметичность реактора правого борта. Негерметичность была устранена без постановки в завод.