Государь редко покидал свои покои. Как и все сыновья Алексея Романова от первой супруги, он родился хилым и болезненным ребенком, и ему часто нездоровилось. Порой он говорил: «Дни мои сочтены, мне недолго остается держать в руках кормило правления; мне нужно подумать о том, кому передать его. Достойнее всех мой младший брат Петр. Богом он назначен царствовать, и не мне ему мешать». Бледный, слабый, он ходил, опираясь на палку, жалуясь на больные ноги. С трудом молодой царь выдерживал приемы в Кремле для иностранных посольств, без посторонней помощи не мог даже снять с головы царский венец. У него часто болели зубы настолько, что он мог с трудом говорить.
За ним ухаживала его сестра Софья, отличавшаяся в противоположность брату крепким телосложением и цветущим здоровьем. Она была на четыре года старше Федора, старалась больше своих сестер быть ему полезной, часто находилась в его покоях, ухаживала за ним и сама давала ему лекарства, когда он болел. А болел сын царя Алексея Михайловича довольно часто, иногда подолгу был прикован к постели.
При таком здоровье царя верховная власть находилась, в его руках только номинально. Да и характер у молодого государя был слабый — он легко поддавался влияниям. Поэтому все управление государством было практически в руках его приближенных, расколовшихся как бы на две партии: приверженцы матери царя, Марии Милославской, и сторонники его мачехи, Натальи Нарышкиной. Верх взяли родственники матери. Царица Наталья вместе со своими детьми должна была оставить Кремлевский дворец и поселиться в селе Преображенском, в трех верстах от Москвы, в летнем доме своего почившего супруга, расположенном на берегу реки Яузы. Теперь уже ей приходилось опасаться за свою судьбу и судьбу детей, внуков первого царя Романова.
Главной опорой «партии Милославских» стала царевна Софья, самая способная и энергичная из сестер Федора. Поскольку из-за своей немощности царь большинство совещаний с боярами проводил в своих покоях, а Софья, вольно или невольно, присутствовала при этом, прислушиваясь к обсуждению государственных вопросов и приобретая тем самым определенные знания и навыки политической деятельности, она стала именно тем человеком, которого многочисленные Милославские решили поставить на высшую ступеньку власти. А ведь до недавнего времени жизнь Софьи была такой же, как жизнь большинства девушек и замужних женщин из знатных московских семей, то есть ограничивалась теремом.
На Руси тогда считалось невозможным, чтобы женщина принимала участие в государственных делах и вообще в беседах мужчин. Она должна была оставаться в своем тереме, где, собственно, девушки и женщины из боярских семей и проводили всю свою жизнь, разве что в церковь они могли ходить, да и то под присмотром. Выходить в люди или свободно передвигаться по городу им не разрешалось. Не суждено им было и вступать в брак по своему выбору. Все зависело от воли батюшки. Отец мог выдать замуж свою дочь за человека, которого она никогда и в глаза-то не видела.
Царевны жили в особых покоях и могли видеть лишь немногих людей, в основном близких родственников. Время они проводили, главным образом, в молитвах или за рукоделием, строго исполняли обряды православной церкви, часто постились. Учились они немногому, выходили из терема только на богомолье. Их строго охраняли от всякого постороннего взгляда из-за боязни греха, соблазна, порчи или сглаза — так сильно было распространено суеверие при московском дворе.
Из тысячи придворных редко кто мог похвалиться тем, что видел царицу и кого-либо из дочерей или сестер государя. Даже придворный врач, — а к его помощи обращались только в самом крайнем случае, — исследовал пульс царевны в темной комнате, причем рука больной обертывалась при этом тонкой материей. Из дворца царица и царевны выезжали только в закрытых каретах. Вход в помещение, к двери которого подъезжала карета, ограждался специальными ширмами. Даже при посещении ими церкви принимались все меры, чтобы оградить их от посторонних взоров, в особенности мужских. А на богомолье в монастырь царица и царевны выезжали чаще всего ночью. Для них специально совершалось богослужение, чтобы не было при этом других богомольцев. В придворной же церкви для женской половины царской семьи было особое место, закрытое плотным занавесом, скрывающим их от любопытных взглядов остальных молящихся. Только в первый день Пасхи царица могла принимать у себя близких родственников и наиболее знатных бояр. На следующий день дверь царского терема вновь закрывалась.
Выдавать царевен замуж за русских подданных царя было не в обычае — не позволяло их высокое положение; для брака с иностранным принцем постоянной преградой оказывалась религия. Поэтому большинство так и оставались девами и кончали зачастую свои дни за монастырской стеной, приняв постриг. Ни любви, ни брака, ни материнства им не суждено было познать.