В декабре Цзян Чжунчжэн переезжает из Хунани в Чунцин через Гуйлинь и учреждает свою ставку в горах Хуаншань («Желтые горы»). (В свое время, еще в 1935 году, Цзян Чжунчжэн посещает провинцию Сычуань и тогда же вырабатывает план создания стратегического тыла в этой провинции на случай войны.)
1939 год. Цзян Чжунчжэну 53 года. Идет 28‑й год Китайской Республики.
В январе на 5‑м пленуме ЦИК ГМД 5‑го созыва принимается решение учредить Высший совет обороны страны, председателем которого, вполне естественно, становится Цзян Чжунчжэн. Ему предоставляется право руководить всеми органами и организациями партии, армии и правительства.
Одновременно он назначается председателем национальной политической конференции представителей всех политических сил и партий Китая.
В марте он обращается с телеграммой к населению страны, объявляя о всеобщей мобилизации в интересах нации.
1 мая в первый раз обращается по радио к армии и народу в связи с проведением первого месячника общенациональных действий.
В том же 1939 году японская армия оккупирует остров Хайнань. 17 апреля в беседе с иностранными журналистами Цзян Чжунчжэн расценивает это событие как равнозначное тому, что произошло 18 сентября 1931 года, но уже применительно к Тихому океану в целом. Иначе говоря, он полагает, что это фактически пролог к войне на Тихом океане.
Тогда же становится явным предательство Ван Цзинвэя. Один из руководителей ЦИК ГМД, заместитель цзунцая партии Ван Цзинвэй в середине декабря 1938 года бежит из Чунцина и выступает с заявлением, в котором поддерживает так называемый «новый порядок» в Азии, то есть открыто становится коллаборационистом; в январе 1939 года Ван Цзинвэй объявляется в Ханое, где продолжает свою предательскую деятельность; в этой связи ЦИК ГМД снимает Ван Цзинвэя со всех постов и исключает его из партии. Цзян Чжунчжэн оказывается в ситуации, когда возникает угроза появления еще одного правительства в фактически воюющей стране, какой в то время является Китай. Вообще следует сказать, что на протяжении 14 лет, с 1931 по 1945 гг., когда Китай борется против агрессии со стороны японской армии, на территории Китайской Республики японцам удается создать несколько марионеточных правительств, формально являющихся китайскими и противопоставляющих себя центральному правительству Китайской Республики во главе с Цзян Чжунчжэном; причем эти правительства (прежде всего правительства Ван Цзинвэя и императора Маньчжоу-Го Пу И) имеют свои армии, насчитывающие сотни тысяч солдат и воюющие на стороне японцев или, во всяком случае, поддерживающие режим японской оккупации на значительной части территории Китая. Таким образом, Войну Сопротивления Цзян Чжунчжэну приходится вести против японской армии и армий, составленных из китайцев и подчиняющихся прояпонским правительствам.
Такова еще одна сложность положения, в котором Цзян Чжунчжэну приходится возглавлять Китайскую Республику в ее борьбе против японского вторжения. 17 апреля того же 1939 года в беседе с китайскими и иностранными журналистами он решительно осуждает теорию и практику капитулянтства. Кроме того, правительство Китайской Республики торжественно заявляет, что оно не признает законными какие бы то ни было документы, подписанные марионеточными властями с иностранными государствами.
При ЦИК ГМД создаются курсы переподготовки кадров. Цзян Чжунчжэн берет на себя руководство и этими курсами.
В марте учреждается центральный профессиональный союз. Это знаменует собой начало кампании, которая впоследствии получает наименование «Движение за подготовку кадров в целях возрождения».
В июне Цзян Цзинго назначается специальным уполномоченным по административным вопросам 4‑го района провинции Цзянси. Собственно говоря, тем самым закладывается начало реконструкции, создания нового общества в южной части провинции Цзянси (причем имеются в виду те районы, в которых ранее власть в своих руках на протяжении некоторого времени держали коммунисты).
В июле начинает свою работу 1‑я Национальная политическая конференция.
В сентябре Цзян Чжунчжэн становится губернатором провинции Сычуань.
В ноябре на 6‑м пленуме ЦИК ГМД 5‑го созыва Цзян Чжунчжэн назначается председателем Исполнительной палаты.