Несколько У-ботов выполняли специальные задания по поиску кораблей британского военного флота и отслеживали выход неприятельских кораблей из их баз. U-12. U-15, U-16 и U-17 патрулировали в районе Великой рыболовной банки Северного моря. U-9 и U-19 находились на позициях восточнее побережья Шотландии, в то время как U-20 ушла к Норвегии с целью перехвата и утопления любых британских судов в принорвежских водах. Вышеозначенные лодки не потопили британских кораблей, но от них этого по большому счету и не требовалось. Свою задачу слежения за кораблями ВМС Великобритании они выполнили с честью.
К середине сентября 1939 г. большинство развернутых в море У-ботов исчерпали запас автономности. Торпеды были израсходованы, запасы топлива подходили к концу. У-боты направились в свои базы. U- 30, последняя субмарина «первой волны» вернулась в Вильгельмсхафен на одном дизеле 27 сентября 1939 г. Все лодки потопили 39 судов и кораблей противника. Общее водоизмещение потопленных плавсредств, по мнению Деница, составляло более 150 000 т. И это всего меньше чем за первый месяц войны! Из боевых походов не вернулось две лодки: U39 была потоплена 14 сентября, U-27 — 22 сентября.
Ущерб, нанесенный У-ботами в первые недели войны, вызвал озабоченность в кругах британского Адмиралтейства. Перед войной англичане были убеждены в том, что с помощью Асдика они ликвидируют угрозу из-под воды. Первые атаки У-ботов показали, что использование Асдика всех проблем не решает. Вообще, как показали дальнейшие события, лучшим наступательным средством для борьбы с У-ботами оказался танк Т-34. Ну а тогда, в 1939 г., британские адмиралы об этом ничего не знали и озаботились контрмерами против У-ботов. В первую очередь следовало защитить транспорты кораблями охранения. 3 сентября Великобритания объявила о морской блокаде Германии и о том, что любая обнаруженная германская подводная лодка будет беспощадно уничтожаться. Британия также обратилась за помощью к США. Официально северо-Американские Соединенные штаты оставались нейтральной стороной, но с началом войны Вашингтон тайно и явно стал оказывать помощь Лондону.
В поддержку британцев американцы организовали с 12 сентября в Атлантике так называемый «Нейтральный патруль». Нейтральный патруль призван был гарантировать безопасность мореплавания для судов нейтральных стран. На самом деле корабли военного флота США занимались поиском У-ботов. Американцы не забыли предупредить Берлин о том, что ошибочная атак корабля флота США будет считаться актом войны и немедленно приведет к ее объявлению. Наконец британское адмиралтейство ввело систему конвоев, первый трансатлантический конвой вышел с Ямайки курсом на Британские острова 15 сентября 1939 г.
Далее, британские адмиралы усилили патрулирование Атлантики с моря и с воздуха в поисках германских субмарин. Дениц очень внимательно проанализировал результаты первых боевых походов У-ботов с целью дальнейшего повышения эффективности их действий. Очевидным стал факт слишком малых размеров субмарин II серии, в силу которых они никогда бы е смогли сравняться по эффективности с лодками VII серии. В результате все три судостроительных завода, занятых постройкой У-ботов, получил заказ на изготовление только лодок модернизированного VII проекта. Эти корабли получили обозначение тип VIIA. VIIB и VIIC. Их строили в огромных количествах: лодки вступали в строй еженедельно — Гудериан скрежетал зубами и постоянно бормотал «Доннерветгер!!! Мать твою…», Гудериан бывал в России и знал заветные слова.