Личный друг основателя русского франкмасонства М. М. Ковалевского, член ложи «Великого Востока Франции» с 1906 г., приятель Сеншоля и Буле31
, которые в 1908 г. покровительствовали русским ложам и контролировали их. В том же году Маргулиес возведен в 18-й градус посвящения, стал «братом в степени Рыцаря Розы и Креста» ложи «Полярная Звезда» в Петербурге и введен в число ораторов Верховного совета русского масонства.В 1914–1917 гг. – товарищ председателя Центрального военно-промышленного комитета, возглавлявшегося А. И. Гучковым, (контролировал крупные военные заказы во время войны), затем – министр торговли Северо-Западного правительства генерала Юденича (1919).
Между прочим, в этом статусе он с другими членами Северо-Западного правительства, возглавляемого также масоном С. Г Лианозовым, по настоянию англичан подписал документ о «признании эстонской независимости». В ответ на это Юденич рассчитывал получить финансовую помощь от союзников и «независимых эстонцев», но так и не получил их.
Зато большевики дали Эстонии, по договору от 2.02.1920 г., 1000 кв. км русских земель, за что, в свою очередь, получили от них содействие в разоружении отрядов Белой армии и право использовать Таллинский порт для незаконного экспорта золота и ценностей, маскируя их российское происхождение.
В 1919 г. Маргулиес эмигрировал в Лондон, затем в Берлин, Париж. Член президиума русских адвокатов за границей. В 1919 г. числился в списках членов парижской ложи «Клемент Амати» в 12-м градусе. В эмиграции развелся с женой (та ушла к масону В. Д. Аитову). Его сын был синологом, долгое время работал в ООН. Сам Маргулиес служил личным секретарем и юрисконсультом у банкира Д. Л. Рубинштейна.
Одновременно с работой на Рубинштейна32
Маргулиес активно подвизается в французских масонских кругах обоих согласий – «Великой ложи Франции» и «Великого Востока Франции», становится одним из основателей лож «Свободная Россия» и «Великий свет Севера» (Берлин, 1920), членом парижского Ареопага, или Капитула, т. е. – масонского Совета народов России, член ложи «Полярная Звезда» (1922).Маргулиес – автор трехтомных мемуаров «Год интервенции» (Берлин, 1923). В начале 20-х годов за попытку организовать сбор средств в помощь голодающим в Советской России был предупрежден руководством «Великого Востока Франции» о возможности наказания («усыпления») за эту «просоветскую деятельность». Оправдываясь, он писал: «Нас обвиняют в распространении ложных слухов, нам нанесли рану, которая не скоро заживет. Мы старались всеми силами вести антисоветскую пропаганду, основанную на фактах, в масонской среде…»33
В 1928 г. – первый надзиратель ложи «Северная Звезда», достигнув 30-го градуса «Рыцаря Кадош» («кадош» по-древнееврейски – «святой»), а в 1930 г. получает высший – 33-й градус.С 1931 г. – досточтимый мастер ложи «Свободная Россия», где тесно сотрудничает с братом этой ложи, руководителем сионизма В. Жаботинским.