Минувшая война произвела настоящую революцию во всех без исключения отраслях военного дела, в том числе и в разведке. Именно в те годы многократно возросла оперативность войсковой разведки и существенно был увеличен радиус ее действий. Для получения достоверной информации о противнике стали использовать мощное вооружение и военную технику, авиацию, бронемашины и т. д. Внезапное нападение 22 июня 1941 г. гитлеровской Германии на CCCР застало советскую военную разведку неподготовленной к работе в условиях войны. Поэтому с первых дней войны ей пришлось действовать вопреки планам, разработанным до начала боевых операций, что, безусловно, сказалось на деятельности всех ее подразделений, особенно войсковой разведки… Перед началом войны и в ходе пограничного сражения летом 1941 г. войсковая разведка не смогла полностью и достоверно вскрыть группировку и нумерацию частей и соединений противника. Имели место и неточные данные о численности танков и резервах противника. В связи с этим уже в сентябре 1941 г. начальник Разведуправления ГШ генерал-лейтенант Голиков Ф. И. докладывал Сталину и начальнику Генштаба Шапошникову Б. М.: «Войсковая разведка на фронте поставлена неудовлетворительно. Руководство ею со стороны какого-нибудь органа в системе НКО отсутствует на протяжении многих лет. Внимание к войсковой разведке в штабах недостаточно». Далее в этой докладной записке были внесены девять предложений по улучшению организации и ведению войсковой разведки. Первое предложение: «Возложить руководство войсковой разведкой на разведуправление Генштаба». Большинство из этих предложений было одобрено Сталиным. И это дало свои результаты. Уже начиная с осени 1941 г. войсковая разведка стала действовать эффективно, приобрела опыт и стройную вертикаль организации, успешно решала поставленные задачи. В 1942 г. было создано Управление войсковой разведки Генштаба Красной армии. 22 ноября 1942 г. Главное разведывательное управление (ГРУ) Генштаба РККА было разделено на два ведомства: ГРУ РККА (разведка за рубежом и на оккупированной территории), которое подчинялось наркому обороны, и Управление войсковой разведки (УВР) Генштаба РККА. 18 апреля 1943 г. Управление войсковой разведки было преобразовано в Разведывательное управление, на которое помимо руководства войсковой разведкой возлагалось и руководство разведкой на оккупированных территориях, переданной из ГРУ. Начальником ГРУ был назначен генерал-лейтенант И. И. Ильичев, а начальником РУ Генштаба – генерал-лейтенант Ф. Ф. Кузнецов.