Волна Октябрьской Революции, может быть, незаслуженно вынесла меня в ряды высшего командного состава, но, по-видимому, я недостаточно высоко нес знамя, врученное мне партией и рабочим классом и второй раз в своей жизни стал на путь лжи перед следственными органами, эту тяжесть своей вины я глубоко сознаю, но предателем и изменником Родине никогда не был и не буду, и на службу контрреволюции на склоне своих лет не стал бы даже в том случае, если бы она каким-либо чудом одержала победу»18
.Но, к великому сожалению С.А. Пугачева, и это пламенное его обращение к Президиуму Всесоюзной конференции ВКП(б) и конкретно к Сталину не смогло тронуть сердца власть имущих. Письмо, как и тысячи другие, было отправлено туда, откуда Семену Андреевичу не раз придется получать неутешительные ответы — в Главную военную прокуратуру. Прошло немногим более месяца, и в лагерь поступил следующий ответ.
«11.2.41 г. Начальнику Севураллага НКВД на №73131 от4.1.-41 г.
Прошу объявить з/к Пугачеву Семену Андреевичу, что по его жалобе, поданной в адрес 18 партконференции ВКП(б), Прокуратурой Союза ССР проведено в порядке надзора его дело. Проверкой установлено, что осужден он правильно и оснований к принесению протеста на приговор Военной коллегии Верховного Суда по его делу не найдено.
Жалоба Пугачева Прокурором Союза ССР оставлена без удовлетворения. Военный прокурор ГВП (Новиков)»19
.Отбывая наказание, Семен Андреевич Пугачев умер в лагере 23 марта 1943 г.
Определением Военной коллегии от 30 июня 1956 г. он был реабилитирован.
Как помнится, следователь Черник, понуждая Пугачева к даче нужных ему показаний, постоянно грозился применить репрессии к семье последнего в случае его отказа или несогласия действовать по сценарию НКВД. Боязнь за свою семью, как не раз признавался Семен Андреевич, была одной из основных причин его показаний на предварительном следствии. И ему удалось ценой собственного позора и унижения спасти жену и детей от ареста и ее растаскивания по частям. Но что ему оказалось не под силу, так это уберечь своих близких от клейма члена семьи изменника Родины и сопутствующих этому лишений и страданий.
В одном из обращений к Н.В. Сталину жена Пугачева — Лариса Дмитриевна писала в 1939 г.:
«Ужасно, Иосиф Виссарионович, видеть обоих детей (2 года — дочери и 8 лет — сыну), которые после переселения в сырую комнату (со стен текло) за три месяца перенесли по два бронхита, а дочь и воспаление легких. Тяжело, очень тяжело, когда у дочери шесть суток температура свыше 40 градусов, врач сомневается, что в условиях комнаты она поправится, а мне напоминают, что срок пользования этой комнатой истек... а прописка по Ленинграду уже кончилась...
Без крова, без работы, с больными детьми, окутанная жутким позором, я близко была к тому, чтобы прекратить существование семьи Пугачевых.
Конечно, для 170 миллионов исчезновение, уничтожение одной семьи из 3-х человек — нуль, но за что?..»20
На Ларисе Дмитриевне С.А. Пугачев был женат вторым браком. От первого брака у него было два сына — Владимир и Николай. Оба они посвятили свою жизнь военной авиации и стали: первый — видным ученым в области боевой эффективности авиационного вооружения, академиком Академии наук СССР, генерал-майором авиации, а второй — военным летчиком, полковником авиации.
Корпусной комиссар Немерзелли Иосиф Фаддеевич был назначен начальником Военно-политической академии имени Н.Г. Толмачева в апреле 1937 г. Тогда академия, как известно, дислоцировалась в Ленинграде, и высокое московское начальство решило подобрать на освободившееся место ее начальника политработника из Ленинградского военного округа. Выбор пал на заместителя начальника политуправления ЛВО Иосифа Немерзелли, который за несколько лет работы на своем посту неплохо знал положение дел в академии, ее командный и профессорско-преподавательский состав. Возглавлял ВПАТ Немерзелли чуть более полугода, проявив себя за это время активным партийным функционером, рьяно выполнявшим установки февральско-мартовского пленума ЦК ВКП(б) по выявлению «замаскировавшихся» врагов народа.