В ходе раскопок у Дюбуа начались конфликты с местными торговцами, которые продавали окаменелости китайским купцам в качестве «костей дракона». Кости использовались как ингредиент для популярного в Китае лекарства от всех болезней. Естественно, торговцы не хотели лишаться источника дохода и отказывались продавать найденные окаменелости Дюбуа. Кроме того, даже его собственные рабочие тайно похищали находки с раскопок и продавали торговцам. Дюбуа пришлось обращаться за помощью к колониальным властям острова Ява, которые запретили продажу окаменелостей китайским купцам.
Особое внимание Дюбуа привлек обрыв над рекой Соло, в окрестностях Тринила. Раскопки там начались в августе 1891 года. В сентябре 1891 года антрополог извлек со дна неглубокой ямки, находящейся на склоне Тринильского мыса, древний зуб. Исследователь очень заинтересовался находкой. Судя по рельефу жевательной поверхности, величине коронки, корням, это был третий коренной зуб, который когда-то находился в челюсти первобытного человека или одной из разновидностей высших приматов – крупной антропоидной обезьяны. Дюбуа все же решил, что зуб принадлежал антропоидной обезьяне типа шимпанзе, потому что размеры коронки оказались не очень велики, корни слишком широко расставлены, к тому же они были непривычно длинные, а не укороченные, как у современного человека.
В своем докладе о поисках в районе деревушки Тринил исследователь назвал «наиболее замечательной находкой верхний третий коренной зуб шимпанзе – Antropopithecus troglodytes». Исследователь сделал вывод, что шимпанзе, «ближайшая из высших антропоидных обезьян, кузина человека» (Дюбуа назвал ее Antropopithecus – «человекообразная обезьяна»), жила миллион лет назад не только в Индии, но и на Яве.
В один из октябрьских дней в окрестностях той же деревни Тринил рабочие наткнулись на нечто шаровидное. Дюбуа понял, что у него в руках черепная крышка того существа, которому принадлежал зуб. Череп сохранился не полностью, у него отсутствовали все лицевые кости. Реконструировать его первоначальный облик было нелегко.
Дюбуа был уверен, что черепная крышка принадлежала крупному антропоиду, вероятно, шимпанзе. Это доказывал сильно покатый, узкий лоб. Наиболее широкая часть черепа, если на него смотреть сверху, располагалась ближе к затылку, а не по центру, как у современного человека. Малая высота черепной крышки выдавала примитивность существа. Об этом же свидетельствовал сильно уплощенный затылок, массивные надглазничные валики, которые нависали над глазницами в виде козырька. Посредине лба, где у обезьян находится костяной гребень, было возвышение в виде валика.
Дюбуа измерил длину и ширину черепа. Результаты измерений озадачили его, они были равны 182 и 130 миллиметрам. Примерная цифра объема мозга – 800–850 кубических сантиметров. А объем мозга высших антропоидных обезьян не превышал 600–610 кубических сантиметров. Исследователь понял, что нашел черепную крышку шимпанзе, который обладал огромным мозгом, практически достигавшим низшей границы объема мозга современного человека – 930 кубических сантиметров.
В 1891 году Дюбуа в отчете написал, что самая замечательная находка октября – антропоидный череп, который с «еще меньшим сомнением, чем коренной зуб, относится к роду Antropopithecus troglodytes. Оба образца, вне каких-либо сомнений, происходят от высшей человекообразной обезьяны (типа шимпанзе)».
В августе 1892 года снова проводились раскопки на Тринильском мысе. На одном из участков была найдена головка бедренной кости с отчетливыми следами зубов крокодила. Дюбуа был поражен, потому что это была полностью сохранившаяся кость бедра не антропоидной обезьяны, а человека. Кость была найдена в том же районе и на той же глубине, что и черепная крышка антропопитека, но в стороне от нее. Кость имела тот же характерный шоколадно-коричневый цвет. Точный ее вес составлял 1018 граммов. На поверхности кости отсутствовали следы коррозии. Но видно было, что кость изуродовала болезнь, бросалось в глаза патологическое разрастание костного вещества на одном из участков. Длина кости равнялась 45,5 сантиметра, что означало, что рост существа составлял около 170 сантиметров.