1925 год вообще оказался знаменательным в истории дома: он передавался Коммунистической (с момента организации в 1918 г. до 1924 г. - Социалистическая) академии. В этом году туда переехал из особняка на Знаменке, 11 (угол нынешних улиц Фрунзе и Маркса и Энгельса), только ее аппарат, а через полтора года - и некоторые входящие в академию институты, секции, состоящие при ней общества, редакции журналов и ее издательство. Председателем президиума стал известный историк М. Н, Покровский.
Поскольку после победы Великой Октябрьской социалистической революции центр международного рабочего и коммунистического движения переместился в Советскую Россию, возникла необходимость в дальнейшей планомерной и последовательной разработке вопросов теории научного социализма и коммунизма. Выполнить эту важнейшую задачу, а также осуществлять борьбу с буржуазными и мелкобуржуазными извращениями марксизма, за строгое проведение принципов диалектического материализма как в общественных, так и в естественных науках и разоблачение идеализма призвана была Коммунистическая академия. Помимо этого, академия должна была в короткий срок воспитать кадры ответственных работников, теоретически подготовленных к выполнению задач социалистического строительства.
Это было совершенно новое научно-исследовательское учреждение, которое охватывало и учебно-просветительные задачи (при академии были открыты курсы марксизма-ленинизма; они потом выделились в самостоятельную организацию), и объединяло всю научно-исследовательскую работу, проводившуюся разрозненно в разных институтах и комиссариатах. «Академия… должна сделаться своего рода Госпланом в области идеологии… организованно поставить на службу советской практики научную марксистскую мысль», - говорилось в редакционной статье «Вестника Социалистической академии» (1922, № 1). Академия привлекла к работе и европейских марксистов, чтобы стимулировать развитие марксистской мысли за рубежом. В состав действительных членов академии были избраны в 1918 году В. Д. Бонч-Бруевич, А. В. Луначарский, М. Н. Покровский, И. И. Скворцов-Степанов, Н. К. Крупская и другие. Позже число членов академии было расширено, в нее вошли О. Ю. Шмидт, П. И. Стучка, А. М. Коллонтай, Г. М. Кржижановский, А. М. Горький, К. А. Тимирязев и другие видные ученые и выдающиеся общественные деятели.
Сначала академия занимала здание бывшей Практической академии коммерческих наук (Покровский бульв., 5), а затем в 1921 году она переезжает на Знаменку, И; оттуда, как уже говорилось, на Волхонку, 14.
Вскоре после переезда академии на Волхонку стали ощущаться теснота и неудобство старого барского особняка. Именно тогда и встал вопрос о надстройке дома. «Управление делами в отчетном 1928/29 году, - читаем мы в кратком отчете о работе Коммунистической академии за 1928 - 1929 гг., - выполнило большую работу, связанную с надстройкой двух этажей над домом по Волхонке, 14… По надстройке 2-х этажей в 1928/29 г. истрачено 572.609 руб. Строительные работы были начаты в июле 1927 года». Несмотря на то что проживший почти два века нетронутым дом потерял свой первоначальный вид (утратил, в частности, фронтон), авторы проекта надстройки отнеслись с уважением к его архитектуре, не нарушив грубо основных пропорций старой части здания.
Теперь Коммунистическая академия разместилась удобно, а выросшая к тому времени библиотека, которая находилась еще в старом здании, на улице Фрунзе, оказалась в крайне стесненном положении: многие книги просто не выдавались из-за того, что невозможно было подступиться к стеллажам. В 1926 году академия возбудила по докладу библиотеки ходатайство об ассигновании ей средств для постройки специального библиотечного здания.
Было составлено несколько проектов, из них приняли проект С. Е. Чернышева. Снесли все старые строения, составлявшие часть бывшей усадьбы С. М. Голицына, кроме, разумеется, главного дома и двух флигелей, и жильцов переселили. Но библиотечное здание так и не было построено.