В 1726 г. при Академии наук основана первая в России Гимназия. Проект устава определял ее как подготовительную при Академическом университете школу, в которой обучали бы «первым фундаментам наук» начинающих учиться, чтобы они «со временем учениями академическими пользоваться могли». Гимназия разделялась на 5 классов. В первых классах изучали латынь, как основой язык. На втором месте был немецкий язык. Дополнительными являлись греческий, французский и итальянский языки. В последних классах изучались общеобразовательные предметы — «история и первые математики начатки, также география с глобусом соединенная».
Устройство гимназии и управление было поручено профессору Г. Байеру. В 1726 г. в гимназию приняли 112 человек, в 1727 г. — 58 человек, затем число поступавших резко упало. По свидетельству Байера, это вызвано отъездом двора Петра II из Петербурга в Москву, куда уехали со своими родителями и многие ученики, а также основанием в Петербурге в 1731 г. Шляхетского кадетского корпуса.
В августе 1725 г. воеводе И. П. Строеву велели освободить дом (он стоял за домом Шафирова) для жилья академическим служителям, за что определена ему плата 250 рублей в год. 30 января 1726 г. сюда перевели канцелярию академии со строгим наказом, чтобы служители ее «в положенные часы были всегда на своих местах и без ведома командиров своих не отлучались».
В 1726 г. в доме Строева начала работу первая в России гимназия. Устав определял ее как подготовительное заведение при Академии, в которой обучали «первым фундаментам наук» начинающих учиться.
В 1726 г. в гимназию приняли 112 человек, в 1727 г. — 58 человек. В доме Строева гимназия просуществовала до 1727 г.
В конце 1727 г. последовал высочайший указ «из домов г. Шафирова и Строева Гимназиум, профессоров и студентов перевести на Преображенский остров, в данные под академию блаженные памяти Прасковьи Федоровны палаты» (Преображенским назывался Васильевский остров). Туда же из дома Шафирова перекочевала и его библиотека, состоявшая из 484 книг, в числе которых имелись рукописные издания.
19 августа 1728 г. дом Шафирова возвращен Петром II его семье. Вдова Шафирова пыталась дом продать, но покупателей не нашлось, и его взяли в казну для размещения «мундирного магазина».
Стоявший рядом с домом Шафирова дом Гагарина после казни его владельца отдали Синоду. Но так как Академии требовались помещения, то на время ей отдали несколько зданий, в том числе и «синодальный дом».
В доме сподвижника Петра I Я. В. Брюса имелась богатая биб лиотека, в которой были книги преимущественно по математике и астрономии. Позднее эта библиотека вместе с этнографической коллекцией и физическими приборами перешла в Академию наук.
Рядом с домом Я. В. Брюса стоял дом УА. Сенявина. Обнаружив большую расторопность в качестве надсмотрщика за работами на верфи Лодейного Поля, он в 1705 г. переведен в Петербург, где ему поручили пост «комиссара» всех строительных работ в городе. В 1706 г. Сенявин открыл «Канцелярию городовых дел» — особое учреждение, которое позднее (до 1723 г.) стало именоваться «Канцелярией от строений».
В конце первой четверти XVIII в. постоянной заботой правительства было изыскание источников пополнения Государственной казны. С этой целью в Петербурге продолжали возводить казенные бани и постоялые дворы. В 1723 г., в связи с постройкой постоялых дворов на Петровской набережной, издан указ, запрещавший жителям города пускать за плату в свои дома приезжих, тем предлагалось останавливаться лишь в казенных постоялых дворах. Эти дворы были своего рода предшественниками городских гостиниц.
К концу 30-х гг. XVIII в. из приближенных Петра I, живших на набережной, уже никого не осталось. В их домах поселились другие люди. Старые дома сносились, перестраивались, на месте некоторых из них появились склады.
Еще в 1824 г. по распоряжению Санкт-Петербургского генерал-губернатора графа М. А. Милорадовича около Гагаринского буяна устроили «заведение для спасения утопающих», на содержание которого отпустили деньги из средств, назначенных «на непредвидимые по городу издержки» (2780 рублей единовременно и почти столько же ежегодно). Заведение не было загружено работой. В 1827 г. обер-полицмейстер докладывал, что за истекшие год и десять месяцев «ни одного утопшего не было в сие заведение представлено». И поэтому предлагал «оное уничтожить».
Домик Петра I — первое строение города — продолжал стоять в неприкосновенности. Мало того, уже в петровское время принято решение о его предохранении от разрушений. В документах 20-х гг. XVIII в. Домик носит название «старых красных хоромцев, что у двора Романа Вилимовича Брюса в роще», или просто «красных хором».