Пока продолжалась детальная разработка плана операции, начались конкретные советские военные приготовления к решению Бессарабского вопроса. Видимо, получив в 20.50–21.55 9 июня соответствующие указания политического руководства[742]
, Б.М. Шапошников в 0.35—1.00 10 июня направил командующим войсками КОВО и ОдВО схожие по содержанию шифротелеграммы с приказом наркома обороны прекратить все организационные мероприятия и «немедленно привести в боевую готовность и подготовить к переброске по желдороге и движению походом» части, предназначенные для Бессарабской кампании, «всю авиацию округа и средства ПВО». Войска приводились «в боевую готовность в существующих штатах без подъема приписного состава и транспорта из народного хозяйства»[743]. В 11.20–11.30 10 июня начальник Генштаба РККА направил командующим войсками ОдВО и КОВО совершенно секретные директивы соответственно № ОУ/583 и № ОУ/584 с указанием районов сосредоточения войск[744]. Кроме того, было решено усилить войска Южного фронта за счет внутренних округов и войск, сосредоточенных для Прибалтийской операции. Так, 10 и 14 июня было приказано перебросить в ОдВО управление 55‐го стрелкового корпуса и 116‐ю стрелковую дивизию из ХВО, а 12 июня – 74‐ю и 164‐ю стрелковые дивизии из СКВО[745]. 17 июня начальник Генштаба приказал перебросить в резерв Южного фронта сосредоточенные на территории ЛВО и КалВО в качестве резерва на случай боев в Прибалтике 8‐ю, 17‐ю, 86‐ю и 100‐ю стрелковые дивизии[746]. 20 июня в состав 9‐й армии была отправлена выведенная из Литвы 21‐я танковая бригада, а в распоряжение командования Южного фронта – выведенная из Риги 214‐я авиадесантная бригада БОВО и 201‐я авиадесантная бригада ЛВО[747].Наряду с сосредоточением сухопутных войск усиливались и ВВС Южного фронта. 17, 19 и 20 июня начальник Генштаба приказал перебросить в КОВО управления 16‐й и 56‐й авиабригад, 17‐й, 20‐й, 33‐й, 149‐й истребительные, 13‐й, 16‐й, 60‐й скоростные бомбардировочные, 51‐й дальнебомбардировочный, 1‐й и 14‐й тяжелобомбардировочные авиаполки из БОВО, а в ОдВО – управления 29‐й и 55‐й авиабригад, 44‐й, 58‐й скоростные бомбардировочные, 3‐й и 7‐й тяжелобомбардировочные авиаполки из ЛВО. Следовало «обратить особое внимание на особую секретность переброски»[748]
. К 22 июня все 14 авиаполков в составе 614 самолетов прибыли в состав ВВС Южного фронта[749]. 15 июня Черноморский флот был приведен в состояние боевой готовности. 26 июня своей директивой № ОМ/755 Генштаб приказал Военному совету КалВО перебросить части связи из Идрицы в Киев в распоряжение КОВО[750]. Кроме того, в тот же день командиру 14‐го стрелкового корпуса ОдВО было приказано организовать оборону черноморского побережья от Очакова до м. Железный. К утру 28 июня части 156‐й стрелковой дивизии были развернуты на западном побережье Крыма от Ак-Мечеть до Николаевки, а также в Феодосии и Керчи[751].