Некоторые элементы строения мягкого тела можно увидеть внутри раковины двустворчатого моллюска, как ископаемого, так и современного. На внутренней поверхности так же, как у брахиопод, хорошо видны отпечатки мускулов-закрывателей и открывателей. Ближе к краю створки проходит линия, которая будто повторяет очертания раковины животного, только в уменьшенном виде. Это тоже следы мускулов, а именно мускулов мантийного поля. Но все же повторить изгиб раковины линии не удается. Она впячивается внутрь створки, словно огибает какую-то преграду. Эта выемка называется мантийным синусом. Синус является признаком хорошо развитого сифона, который засасывает воду в раковину или выталкивает её.
Не менее важные подробности строения тела животного можно узнать по сохранившимся костям. На поверхности костей существует ряд выступов, гребней или не слишком выдающихся неровностей (иногда их можно назвать даже шероховатостями), которые могут рассказать о многом. Например, на плечевых костях человека находится дельтовидная шероховатость (иногда называемая бугристостью) – место прикрепления дельтовидной мышцы.