Герой романа «В тени алтарей», частью из-за своеобразных условий, создаваемых его саном, а частично из-за врожденных свойств характера настолько придавлен трагедией своего одиночества, что не в состоянии даже задуматься о каком-либо общественном протесте. Он протестует молча, про себя, да и то весьма нерешительно, долгое время пытаясь найти какое-нибудь компромиссное решение вопроса. Один из таких компромиссов — это выдуманный им лозунг «когда я ксендз — я не поэт, когда поэт — я не ксендз».
Сколько мучений, сколько колебаний пережил Васарис, пока он решился наконец на первый бунтарский шаг, на отказ от звания ксендза!
Без сомнения, Васарис был бы смелее и решительнее в своих действиях, если бы жизнь столкнула его с какими-нибудь прогрессивными силами общества. Какое это могло бы иметь влияние в становлении личности героя, можно себе представить хотя бы на основании следующего: Васарис не раз вспоминает революционные дни 1905 г., свое участие в кружке передовых учеников. Воспоминания эти всегда поднимают его настроение, укрепляют волю к сопротивлению. Вот что пишет он об этом в своем дневнике: «…первомайская песня и сегодня еще звучит в моих ушах, еще и сегодня я напеваю ее, и напевая, чувствую радость жизни. И сегодня я среди тех, которые хотят, если не реформировать, то по крайней мере исправить жизнь, не материальную, а духовную. А это ведь еще важнее. Сегодня я, лучше чем в ту пору, понимаю, какие нужны изменения, вижу и цель и средства, ведущие к реформе или к исправлению жизни. Но где энтузиазм и решимость, которые переполняли нас тогда на берегу Шешупе? Я напеваю первомайскую песню, и она будит во мне смелость. Но как бессмысленна в этих стенах моя смелость и как скоро она исчезает! Все-таки во мне, видно, и до сих пор не погасли искорки революционного огня, они-то и не позволяют мне окончательно проникнуться семинарским духом».
Конечно, это, даже весьма слабое, эхо революционных событий 1905 г. в сознании индивидуалиста Васариса приобрело совершенно иной, идеалистический смысл. И тем не менее, насколько отзвук этих событий значителен для Васариса, как помогли ему такие воспоминания на пути к освобождению, в его бунте!
Одна из важных и примечательных тем в романе В. Миколайтиса-Путинаса — это борьба Васариса за свои естественные права человека и в то же время протест против догм и обетов, бессмысленно лишающих человека счастья и радости жизни.
Васарис далеко не безбожник. Он, даже порвав со священством, обещает в дальнейшем оставаться истинно верующим христианином. Васарис слишком слаб и слишком подавлен, чтобы поднять бунт против бога; он мечтает только лишь освободиться от тех страшных ограничений, которые, по его пониманию, совершенно не нужны богу. Но материал романа позволяет читателю делать значительно более широкие выводы…
С этой точки зрения весьма знаменательно то, как изображены в романе взаимоотношения Васариса и Люции. Люция — первая любовь Васариса, сыгравшая огромную роль во всей его жизни. Чувство это, бесконечно светлое и ясное, заронило в юную душу Васариса семена любви к прекрасному и радости бытия, возбуждало в нем со временем все возраставший протест против догм священства. Так же, как Незнакомка в соборе воплощала в душе Васариса романтическую мечту, так Люция своей юностью несла ему радость бытия и счастье, от которых Васарису чем дальше, тем труднее было отказаться. Люция первая заставила его усомниться в необходимости соблюдения религиозных догм. Но из-за своей нерешительности, в результате влияния семинарского воспитания, Васарис убоялся своей любви и бежал от нее, причинив этим много мучений не столько даже себе, сколько самой Люции.
Любовь Люце сыграла для Васариса большую роль в годы учения в семинарии. Позже он нашел настоящую поддержку и опору в лице баронессы Райнакене и Ауксе. Но для Люции отказ от нее Васариса имел трагические последствия. Это было первое и последнее настоящее ее чувство, и неудача в этой любви сломила ее жизнь и привела к самоубийству. Смерть Люции тяжелым бременем, словно обвинение, легла на совесть Васариса и явилась как бы своего рода протестом против жестокости церковных догм, которые даже самый приход Люции в жизнь, ее рождение, сделали ненужным, ложным, заранее осудив его (Люция была незаконной дочерью ксендза).
Трагедия Люце, гибель всех юношеских иллюзий Васариса и Люце особенно ярко подчеркивают, что в романе, как теперь считает и сам автор, «надо было решать вопрос по существу: оправдано ли жизнью существование духовенства, нужно ли таковое вообще». К сожалению, этого вопроса автор в романе не ставил, как не ставил и других общественных проблем, хотя они и вставали по ходу действия в рамках психологического конфликта.