Между 26 и 31 мая 1918 года, в ходе мятежа Чехословацкого корпуса, в Новониколаевске и Томске заявило о себе первое из «народных» правительств — Сибирское. Во взятых чехословаками городах вышел из подполья и объявил себя легитимной властью так называемый Западносибирский комиссариат, действующий от имени Временного правительства автономной Сибири.
Это правительство, во главе с одним из лидеров сибирских эсеров П. Дербером, было сформировано еще в январе 1918 года на подпольном заседании Сибирской областной думы, которая, в противовес Советам, заявила, что
В Томске для координации действий был оставлен Западносибирский комиссариат (ЗСК) из четырех уполномоченных правительства. Он опирался на уполномоченных более низкого уровня, в том числе на лидеров кооперации. Эта структура в конце мая 1918 года и объявила себя полномочной властью.
На территории Западной Сибири также находились пятеро членов правительства Дербера, не отправившихся вслед за премьером в Читу и на Дальний Восток. Но их участие в работе подполья остается вопросом спорным, а дальнейшая деятельность — неоднозначной.
Первые недели легального существования ЗСК посвятил вопросами формирования аппарата правительства и выборам места его постоянной дислокации. Дело в том, что руководство боевых групп и эсеровских дружин сосредоточилось в уездном Новониколаевске, на железнодорожной станции (боевые действия, как мы помним, велись по преимуществу вдоль железнодорожных путей), в то время, как ряд уполномоченных осуществляли свою деятельность из Томска. Губернская столица, однако, при всех своих преимуществах, обладала существенным недостатком — удаленностью от Транссиба. В итоге именно Новониколаевск, как находящийся в центре событий, был избран местом базирования ЗСК.
Впрочем, осуществив переезд, члены комиссариата столкнулись с новой проблемой — кадровым голодом. Небольшой город просто не обладал достаточным числом управленческих и технических кадров для формирования аппарата правительства. Вскоре было принято решение о новом переезде — на этот раз в Омск, столицу бывшего Генерал-губернаторства. 12 июня специальная делегация комиссариата прибыла в город для решения кадровых и административных вопросов.
Все это время продолжалась дискуссия о политической структуре власти. В эсеровских кругах были сформулированы три подхода к этой проблеме. Одни подчеркивали, что правительство Дербера, именем которого действовал ЗСК, есть правительство социалистическое, а не буржуазное:
Впрочем, оставался третий вариант, способный, как казалось, разрешить сложившуюся коллизию. Его сторонники утверждали: нет ничего страшного в приглашении представителей буржуазии в правительство, но не в качестве партнеров по коалиции, а как
Ясно, что такая позиция была наиболее популярна, позволяя с одной стороны разрешить кадровый вопрос, с другой — соблюсти положенный политес «ко всем классам» и с третьей — не вступать в формальную коалицию, связывая себя определенными обязательствами.