В ноябре 1936 года Иванов повез личное письмо с политическими предложениями в Москву на VIII Всесоюзный съезд Советов, на котором планировалось принять новую Конституцию СССР. По его мнению, в проекте новой (сталинской) Конституции не были учтены права заключенных и умалишенных. В Москве на Красной площади Иванов, без документов, обнаженный и босой, был задержан милицией и доставлен сначала на Лубянку, где с ним беседовал глава НКВД, а затем в следственный изолятор Матросская тишина. Диагноз Ростовской психиатрической больницы, поставленный Иванову в начале 1936 года, спас ему жизнь. Через 67 суток под конвоем и в одежде он был доставлен к месту жительства.
Зимой 1937 года Иванов был арестован сотрудниками НКВД города Моздок как «диверсант». Проверялся на закаленность: при 17 градусах мороза его длительное время обливали водой из колодца. Через 3 месяца был отпущен с извинениями.
Во время войны осенью 1942 года Иванов встречался с немецким генералом Паулюсом во время дислокации его штаба в Красном Сулине. Результатом встречи был охранный документ на немецком языке, выданный Иванову, за подписью Паулюса. В документе говорится, что Иванов «представляет интерес для мировой науки». Несмотря на охранный документ, в ноябре 1942 года Иванов 27 суток испытывался в днепропетровском гестапо (закапывали голого в снег, ночью под 22 ноября в сильный мороз возили раздетым на мотоцикле по улицам Днепропетровска).
В декабре 1943 года, когда итог войны был фактически предрешен, Иванов поехал к Сталину с политическим предложением заключить мир с Германией. Однако голого человека зимой на вокзале, утверждающего, что он прибыл с политическими требованиями, милиция доставила в Институт судебной психиатрии им. Сербского, где он находился около почти три месяца.
Кстати, Иванов считал, что в поражении Германии в войне есть и его заслуга, так как он «просил природу, чтобы победил русский солдат».
Поздней осенью 1948 года (23 ноября — 5 декабря), в год своего 50-летия и 15-летия своей идеи, Иванов осуществил экстремальный эксперимент — проход от Туапсе до Сочи вдоль берега Черного моря. В своих записях и рассказах Иванов утверждал, что начинался проход во время 12-балльного шторма на море, и 12 суток он находился в естественных условиях природы без пищи, одежды и жилого дома.
13 февраля 1951 года Иванова арестовали в Москве по статье 58–10 часть 1 УК РСФСР — антисоветская агитация. 14 апреля 1951 года особым совещанием при МГБ СССР он был направлен на принудительное лечение в соединении с изоляцией. Содержался во всех трех существовавших в то время специальных психиатрических больницах тюремного типа МВД СССР — в Ленинграде (Ленинградская специальная психиатрическая больница тюремного типа), Чистополе и Казани (Казанская тюремная психиатрическая больница НКВД СССР), примерно по году или более в каждой. Был освобожден 29 ноября 1954 года.
23 мая 1964 года Иванова арестовали в Бобринецком районе Кировоградской области (Украина), было возбуждено уголовное дело по статье 143 часть 2 УК Украины (мошенничество). В то время еще не было тоталитарных сект, иначе его обвинили бы в ее создании. Он организовал «Клуб любителей природы», вел активный поиск учеников, обещая всем, кто вступит в организацию (заплатив немалый вступительный взнос) и будет следовать его учению, «жизнь вечную и здоровье до конца дней». Он обещал излечить все болезни, даже неизлечимые, и главными лекарствами называл воду, солнце и ветер. После ареста Иванов был отправлен на экспертизу в Институт судебной психиатрии им. Сербского, где признан невменяемым. Поскольку все «сектанты» единогласно заявили, что не платили за обучение, а вносили добровольные пожертвования, уголовное дело, заведенное на Иванова, было прекращено.
В 1971 году на хуторе Верхний Кондрючий (Свердловский район Луганской области) его учениками был построен так называемый «Дом учителя», который они подарили Иванову на День рождения. Он подарок охотно принял, стал в нем жить и принимать людей.
25 апреля 1975 года Иванов отмечает 42 года своей идеи поездкой большой группой своих учеников-последователей (около сотни человек) на Чувилкин бугор (место недалеко от родного села Ореховка, с которым Иванов связывал начало своей идеи). Затем он устраивает обед в Ореховке, на который приходит много односельчан. Иванов говорит, что на Чувилкином бугре родится новый человек («сын божий»), который сыграет большую роль в будущем. Там же он делает пророчество о втором пришествии и говорит, что человек, родившийся 15 июля 1975 года в тех местах в будущем, станет правителем не только России, но и мира.