Торговое соперничество лежало в основе затяжной борьбы за превосходство между морскими республиками — Венецией и Генуей. Пиза, третий конкурент, начала сосредоточивать внимание и ресурсы на западной части Средиземного моря с первой половины XIII века, столкнувшись с успехом своих соперниц в Леванте. Поражение, которое Пиза потерпела от Генуи при Мелории в 1284-м, навсегда лишило ее шансов на победу в этой борьбе. Кроме небольших стычек между Венецией и Генуей, прошли три крупные войны с 1255-го по 1381-й. Сражения — в Палестине, на Черном море, в Эгейском море и иногда в опасной близости от дома — стоили каждому городу тысяч погибших. Венецианские корабли одержали сокрушительную победу над генуэзцами при Акре в 1258-м и Трапани в 1266-м, но сочетание корсарских набегов и умелой дипломатии вскоре позволило Генуе вернуть себе былое влияние. Генуя очень своевременно заключила союз с византийским императором в 1261 году, как раз перед тем как он изгнал из Константинополя латинян и восстановил греческое правление. У берегов острова Курзола в сентябре 1298-го венецианцы потерпели страшное поражение от превосходящего их численностью флота Оберто Дориа; 9000 человек было убито и ранено и 400 попало в плен (включая Марко Поло, который как раз в этом плену и диктовал рассказы о своих путешествиях). Но снова восстановление произошло удивительно быстро, главной причиной тому явилась высочайшая производительность Арсенала, который немедленно приступил к работе и в самые короткие сроки выстроил сотни галер взамен потопленных и захваченных. Чтобы продемонстрировать, как мало венецианцы напуганы случившимся, некий капитан Доменико Скьяво спокойно приплыл в генуэзскую гавань и прибил к пирсу золотой дукат — впервые отчеканенный в 1248-м и долго еще остававшийся символом богатства и непоколебимости Венеции.
Более полувека (1299–1350) республики поддерживали между собой хрупкий мир. Это совпало с периодом приумножения богатства Венеции, и значительная доля ее капиталов тратилась на украшение города: в 1341-м начались работы над Дворцом дожей, в 1330-м была перестроена и приобрела свой сегодняшний облик грандиозная францисканская церковь Фрари, а в 1333-м — доминиканская церковь Санти-Джованни-э-Паоло.
На какое-то время развитие архитектуры и коммерции замерло с приходом «черной смерти», которую принесли в город моряки с Востока в 1348-м. Примерно три пятых населения умерло от чумы. Но очень скоро выжившие снова взялись не только за строительство, но и приступили к военным действиям. Генуэзская агрессия в Черном море послужила началом новой войны, где противникам везло с переменным успехом. В феврале 1352-го венецианцы потерпели еще одно крупное поражение на Босфоре, но в августе 1353 — го венецианский флот под предводительством Николо Пизани со своими арагонскими союзниками разгромили своих врагов у Сардинии, а затем в ноябре 1354-го генуэзцы неожиданно напали на Пизани и захватили все пятьдесят шесть его кораблей, в то время как большая часть их флота села на мель в Портолонго на юге Греции. И снова истощенные противники в 1355-м заключили мир. Он длился двадцать один год, пока не начался спор о том, кому занимать остров Тенедос. Так началась «война Кьоджи», которая чуть не стала причиной преждевременного упадка Венецианской республики.
В 1379-м была захвачена Кьоджа, город на самом юге лагуны, и казалось, конец близок. Но благодаря удаче, а еще больше — решительности Венеции удалось повернуть дело в свою сторону и взять верх над Пьетро Дориа и его генуэзцами. Они нагрузили корабли камнями, затопили их и заблокировали генуэзцев в Кьодже. Убеленный сединами дож Андреа Контарини лично возглавил предназначенную к затоплению флотилию, и это значительно подняло боевой дух венецианцев, напомнив им о славном прошлом дожа-крестоносца. Но еще больше энтузиазма вызвал только что назначенный командором Виттор Пизани, который и разработал план экспедиции. По требованию народа Пизани только что выпустили из тюрьмы, куда его посадили после недавнего поражения на Босфоре. Кьоджу удалось вернуть в июне 1380-го. Пизани не дожил до празднования этого события; он скончался от ран после небольшого столкновения у Апулии в августе того же года. В 1381 году был заключен новый мирный договор. На этот раз мир длился долго, так как для Генуи начался продолжительный период политической и экономической нестабильности.