Вирусы: Скорее друзья, чем враги

Что касается эндогенного ВИЧ, существует прецедент: очень показателен пример «пенистых» вирусов. Они напоминают ВИЧ в том смысле, что имеют много дополнительных генов и демонстрируют сложную регуляцию генной экспрессии. Однако эти вирусы не патогенны для человека. Название «пенистые» дано вирусам по внешнему виду легких инфицированных животных или клеточных культур. Они могут инфицировать обезьян и человека, но не являются болезнетворными. Вирусы реплицируются только в организме обезьян, поэтому организм человека – «тупиковая ветвь эволюции» для данного вируса. Он безвреден для человека. «Пенистые» вирусы – самые старые из всех известных сложных (ВИЧ-подобных) ретровирусов, которым 100 млн лет. Сколько времени требуется вирусу, чтобы стать безвредным? Мы не знаем, но это точно происходит. Безусловно. SIV не убивает обезьян – больше не убивает, – но когда он перестал это делать?

Вероятно, подобные вирусы есть еще. Их трудно выявить, поскольку их геном состоит из ДНК, и таким образом, на первый взгляд они не напоминают ретровирусы. Кроме того, вирус овец (, эквивалентный вирусу HERV-W, формирующий плаценту человека) существует в форме как экзогенного, так и эндогенного вируса.

Вирусы рыб также способны играть двойную роль – как экзогенно реплицирующиеся ретровирусы и как интегрирующиеся эндогенизированные вирусы. О вирусах рыб известно очень мало, однако количество рыбоводческих хозяйств в настоящее время растет, чтобы справиться со спросом на продовольствие. Возможно, у какого-нибудь вирусолога может возникнуть желание исследовать эти вирусы и поехать к немке Кристиане Нюсляйн-Фольхард, лауреату Нобелевской премии, которая в своих аквариумах, расположенных под крышей Общества Макса Планка в Тюбингене, держит 20 000 данио (рыбок-зебр) и разводит их. Эти рыбки очень часто используются для исследований, поскольку они прозрачны и можно наблюдать эффекты их мутаций. В США за научные достижения Кристиану приветствовали стоя. Королева мух стала королевой рыб. У них, безусловно, есть вирусы, просто мы пока о них мало знаем.

Палеовирусология

Сколько различных типов эндогенных вирусов в настоящее время находится в нашем геноме? До сих пор речь шла о том, что ретровирусы могут интегрироваться двумя путями: горизонтальным и вертикальным переносом генов. Вирусные частицы распространяются от клетки к клетке или от одного животного к другому путем горизонтального переноса генов. Кроме того, существуют вертикально переносимые ретровирусы, которые инфицируют зародышевые клетки и интегрируются в зародышевые линии. Такие вирусы в этих клетках передаются следующему поколению. Когда был секвенирован геном человека, в нем выявили не только последовательности ретровирусов, но также (ДНК) последовательности ДНК-содержащих вирусов и ДНК из РНК-содержащих вирусов – вируса болезни Борна и вируса Эбола. Обычно эти два вируса никогда не адаптируют промежуточную ДНК. Она каким-то «секретным образом превращается» в ДНК-содержащие вирусы, используя необычный механизм. Возможно, обратная транскриптаза была позаимствована внутри клетки и способствовала обратной транскрипции РНК в ДНК, чтобы РНК-содержащие вирусы в качестве ДНК-копий могли интегрироваться в геном. Как мы недавно выяснили, наши клетки полны ОТ. Они могут происходить от других ретровирусов или ретротранспозонов и становятся «заимствованными». Так в геном животных интегрируются вирусы болезни Борна и вирус Эбола. Последовательность их геномов со временем не слишком изменилась, и можно предположить, что у них есть свое предназначение. Они действительно обеспечивают защиту от новых инфекций, провоцируемую тем же вирусом путем интерференции. Вирусы болезни Борна присутствуют в виде ДНК у многих видов животных – у человека, обезьян, мартышек, слонов, лемуров, мышей, крыс и птиц, но не у лошадей. Возможно, именно так у человека сформировалась невосприимчивость: последовательности эндогенных вирусов болезни Борна обеспечивают защиту от заражения экзогенным вирусом болезни Борна. У лошадей не обнаружены эндогенные вирусы болезни Борна, и их действительно поражают экзогенные вирусы болезни Борна и даже вызывают депрессию – да, у лошадей бывает депрессия. У человека эндогенные вирусы болезни Борна экспрессируют некоторые высококонсервативные ядерные белки вируса, защищающие нас от новых вирусных инфекций. У человека депрессия имеет иные причины.