Вирусы: Скорее друзья, чем враги

Ма-вирофаги инфицируют еще один вид гигантских вирусов, который называется  (CroV). Надо же, какое название! Вирус назван не в честь открывшего его ученого, а носит имя кафе в датском городе Ренбьерг. Информацию по этому вирусу получить было довольно сложно, пока я не позвонила специалисту по вирофагам Маттиасу Фишеру из Гейдельберга. Cro – одноклеточный жгутиковый организм (микрофлагеллат), эукариот, питающийся бактериями, но непохожий на амеб или водоросли. Он широко распространен в Мировом океане и может существовать на больших глубинах. Его гигантский вирус CroV, вызывает разрушение жгутиков, регулируя таким образом плотность их популяции. CroV – вирус, носящий название кафе, в настоящее время исследуется Матиасом Фишером, бывшим студентом Кёртиса Саттла. Этот вирус состоит из 730 000 пар оснований и 544 генов, полученных от бактерий, эукариотов и ДНК фагов. Крейг Вентер собрал образцы этого вируса, содержащие вирофаг Ма (и вовсе не рядом с кафе). Завершив секвенирование генома человека, Вентер совместил исследовательскую деятельность с увлечением мореплаванием. Когда его судно находилось в Саргассовом море[14] (Атлантический океан), Вентер собрал образцы воды и передал их другим исследователям для проведения секвенирования и анализа. Сейчас обработкой этих данных занимается несколько специалистов по биоинформатике. Нам открывается мир геномов, в котором большинство генов и путей метаболизма неизвестны. Жизнь на дне океана очень отличается от нашей жизни. И это удивительно.

Ма-вирофаг, так же другой вирофаг, , реплицируется на «фабрике по производству вирусов» внутри амебы, при этом амеба его не пожирает. Только четыре гена Ма-вирофага из имеющихся у него 20 идентичны генам . Ма-вирофаг является носителем даже ретровирусных генов, в частности интегразы вируса. (.) В то же время Ма использует вирус CroV, получивший имя по названию кафе, в качестве хозяина для репликации, а затем уничтожает его, как это делают фаги. Итак, Ма – это ретровирус для одного хозяина и фаг для другого, то есть пятьдесят на пятьдесят. Насколько мне известно, явление уникальное. Получается, что это – интересное промежуточное звено эволюции. Он эксплуатирует и помогает, демонстрирует и социальное, и эгоистичное поведение одновременно. Невозможно было бы представить себе столь сложные взаимоотношения – прямо-таки 

Организация «Исследование Мирового океана» занимается поиском других вирофагов. Возможно, вирофаги – явление нередкое. Между тем в настоящее время выявлено шесть вирофагов. Один из них называется вирофагом Органического озера в Антарктике (), а другой – . Новый мимивирус  также является носителем вирофага. А теперь можно приступить к сравнению состава генов вирофагов, которые имеют несколько источников генов.

Дорогой читатель, не старайтесь все это запомнить. Вполне достаточно, если вы просто удивитесь!

Вирусы размера XXL – пандовирусы

До того, как закончить главу о «гигантских вирусах», ее нужно дополнить.

С настоящего времени следует добавлять даты открытия – настолько быстро выявляются новые вирусы. После 20 июля 2013 г. появились сообщения об открытии двух новых вирусов. До того самым крупным гигантским вирусом считался амебный вирус с 1,25 млн пар оснований. Назовем его XL. Сейчас обнаружены два новых, еще более крупных вируса, которые почти в два раза больше XL-вируса – это супергигантские XXL-вирусы. Их ДНК состоит из 1,90–2,47 млн пар оснований, что соответствует 1900–2500 генов или генных продуктов. Жан-Мишель Клавери из Марселя выделил новые вирусы: первый – пандовирус  самый большой из всех известных гигантских вирусов, обнаруженный в осадочных породах на побережье Чили, а второй –  обнаруженный в австралийском пруду. Клавери пригласили читать лекции в австралийский университет, и, проходя мимо пруда, находящегося на территории кампуса, он наполнил стеклянную бутылку водой и грязью из этого пруда. А придя домой, изолировал Одновременное открытие двух гигантских вирусов в столь отдаленных друг от друга регионах не может быть счастливой случайностью. У этих вирусов должно быть нечто общее.

Недавно открытые вирусы внешне напоминают греческую амфору или – если использовать менее поэтичное сравнение – у них не икосаэдральная, а яйцевидная форма. И все же не форма определила их название, а, скорее, оптимизм ученого, который их обнаружил и который полагал, что будет открыто больше таких вирусов, согласно греческой легенде о ящике Пандоры – ящике, полном вирусов. Весьма оптимистичное предположение. Возможно, даже появятся огромные XXXL-вирусы. Как знать! Вероятно, их будет трудно отличить от бактерий, и все равно их могут не заметить!