Там, за сутки до атаки, корабли должны были последний раз дозаправиться топливом и под покровом темноты двинуться на восток — прямо к их цели. С первыми же лучами рассвета можно было начать взлет самолетов. Обычно за подготовку и боевую готовность летчиков и самолетов несли ответственность командиры авианосцев и командарм их авиагрупп. Однако в этой атаке самолетами со всех авианосцев должен был командовать, координируя их действия, единый командир. Им был выбран командир авиагруппы авианосца «Акаги», капитан 2 ранга Мицуо Футида, тридатидевятилетний ветеран китайской войны, налетавший уже три тысячи часов. Не все командиры авианосцев согласились бы с этим выбором, но так решил адмирал Кусака.
Главной целью, соответственно плану капитана 2 ранга Генда, был так называемый «Линкорный ряд», две колонны американских линейных кораблей, стоявшие на швартовах у острова Форд в центре Перл-Харбора. Сначала в атаку должны были выйти самолеты-торпедоносцы и нанести торпедный удар по кораблям внешнего ряда. Затем корабли внутреннего ряда должны были попасть под удар горизонтальных и пикирующих бомбардировщиков.
Кусака понимал, что успех второго удара зависит полностью от точности бомбометания. Японцы знали об американском бомбовом прицеле типа «Норден», но добыть его не смогли. Кроме того, в их распоряжении не было и авиабомб, способных пробить, не взорвавшись, могучую палубную броню американских линкоров. Решением первой проблемы была усиленная тренировки пилотов в пользовании не очень надежным бомбовым прицелом типа 97, скопированным с германской модели.
Для решения второй проблемы Генда, Футида и их помощники также нашли простое решение: к бронебойным снарядам главного калибра линкоров приделывались стабилизаторы, и они превращались в мощные авиабомбы, взрывавшиеся только после пробития брони.
До начала войны в Европе японский генеральный штаб не мыслил категориями глобальной войны, ограничивая планы ближайшими азиатскими странами. Но когда среди воюющих стран появилась Англия, японцы начали готовиться к боевым действиям против нее и Америки.
Из генштаба в Юго-Восточную Азию для оценки стратегической обстановки был командирован способнейший оперативник, майор Кумао Имото. Майор побывал в Гонконге, Ханое, Сайгоне и Сингапуре. Возвратившись в Токио, он составил предварительные планы захвата Гонконга и Сингапура.
На следующий год еще несколько генштабистов были посланы дальше на юг, чтобы определить возможность вторжения на Яву, Суматру и Филиппины. Однако, составленные планы были слишком контурными, недетализированными, поскольку никакая разведывательная деятельность в этих районах не велась. Правда, там можно было рассчитывать на помощь со стороны японской дипаспоры и туземного населения. Многие филиппинцы еще с тоской вспоминали Эмилио Агвинальдо, предпринявшего в начале века героическую, хотя и неуспешную попытку свергнугь на островах власть американцев. На Британских и Голландских территориях подавляющее большинство туземного населения с восторгом воспринимало любой слух о прекращении господства белых.