Между Манчестером и Кромвелем почти сразу возникли разногласия. Манчестера, который после попытки короля в январе 1642 г. арестовать его вместе с пятью членами палаты общин и который был твердым приверженцем дела парламента, похоже, стали одолевать сомнения, а Кромвеля, который всего за год до этого просил парламент назначить Манчестера командующим, теперь с каждой неделей все больше возмущали его действия. По характеру они не соответствовали друг другу: Манчестер, несмотря на свою искреннюю набожность, был мягким, светским, хорошо воспитанным человеком, в высшей степени аристократичным, разборчивым и элегантным в одежде, вкусах и манерах и ничем не походил на грубоватого грозного Кромвеля. Но у Манчестера была реальная причина для сомнений и апатии, охватившей его после завершения осады Йорка. Возможно, для него стал потрясением короткий визит, который в июне нанес в лагерь осаждавших молодой Вейн. Вейн приехал, чтобы проконсультироваться с высшими командирами – и английскими, и шотландскими, так удобно собравшимися под стенами Йорка, – по поводу крайне важного на тот момент политического вопроса. Речь шла ни больше ни меньше как о свержении короля. Вполне возможно, в качестве замены называлось имя старшего брата Руперта, курфюрста Палатина. Этот принц, теперь находившийся в Голландии, имел свои личные каналы связи с Вейном, чей младший брат и шурин входили в ближний круг его матери в Гааге. Недавно он, желая продемонстрировать свою солидарность с парламентом и шотландцами, представил Ковенант на религиозном собрании в Дельфте. Впрочем, Вейн, личные симпатии которого склонялись в сторону республики, мог и не дойти до того, чтобы предлагать нового короля, поскольку лорд Ливен, Ферфаксы и Манчестер единодушно категорически отказались от идеи свержения Карла. Если Кромвель участвовал в этих консультациях, то маловероятно, чтобы он выразил несогласие с единодушным мнением старших командиров, но было известно, что он питал дружеские чувства к Вейну и разделял многие из его радикальных политических идей. Именно вскоре после визита Вейна в Йорк Манчестер стал тревожиться о будущем короля, с подозрением относиться к Кромвелю и чувствовать усталость от тягот войны.
Он на десять дней задержался в Донкастере и почти на месяц в Линкольне. Манчестер не стал захватывать Ньюарк, хотя тот казался очевидной целью. Его с трудом удалось убедить принять капитуляцию Вельбека, где домочадцы и дети Ньюкасла, брошенные маркизом на произвол судьбы, беспокоились только о том, чтобы договориться об условиях сдачи. Когда Джон Лилберн при поддержке одного из друзей Кромвеля Генри Айртона захватил маленькую крепость Тикхилл, Манчестер открыто в присутствии множества свидетелей оскорбил его, обозвав «невежей». Положение в армии Восточной ассоциации было далеко от благополучного, и сторонники Кромвеля сформировали вокруг него группу, которая расколола когда-то единые войска на две враждующие фракции.
Шотландская армия под началом Ливена и Дэвида Лесли, со своей стороны, очень хотела перенести свои действия ближе к собственным границам, где они постоянно ждали неприятностей. В июне они какое-то недолгое время опасались, что сам Руперт, вместо того чтобы идти на Йорк, повернет и вторгнется в Шотландию. Этот страх улетучился, но Монтроз по-прежнему никуда не делся. Шотландский Комитет сословий, который после того, как в ноябре 1641 г. Карл распустил на три года, в соответствии с этим решением собрался вновь в июне 1644-го, невзирая на изменившиеся обстоятельства, и открыто взбунтовался против короля. Теперь, после смерти графа Лодердейла, председателем парламента стал его сын лорд Мейтланд. Его двойственная роль как главного шотландского уполномоченного при английском парламенте и председателя их собственного парламента ясно давала понять, что цель этой встречи – укрепить альянс и продолжить войну против короля. Первым решением шотландских парламентариев стало назначение графа Калландера командующим войсками, которые должны были покончить с силами Монтроза на границе.
Внешне все в целом выглядело спокойно, и их главная работа заключалась в том, чтобы отправить на эшафот захваченных весной роялистов. Но отовсюду поступали сообщения о дурных знаках, плохих предзнаменованиях и тревожных слухах. В заливе Мори-Ферт один кит погнался за другим и выбросился на берег у Таррадейла, то тут, то там говорили, что из родников начинала течь кровь, капли крови люди видели на воде в колодце, хотя, по крайней мере в том случае, оказалось, что это устроил какой-то шутник.