Хотя эта проведенная в 1941 году и в начале 1942 года всеобъемлющая реорганизация управления и организационной структуры ПВО страны централизовала ресурсы и улучшила противовоздушную оборону в действующих фронтах и в тылу, рост и быстрое количественное увеличение войск ПВО усложнили управление ими. Особенно это коснулось защиты жизненноважных промышленных и административных объектов. В результате 31 мая 1942 года НКО расформировал Управление ПВО страны, передав все его управления и отделы Громадину, командующему ПВО страны, обеспечив его двумя заместителями, первый из которых отвечал за подготовку личного состава и центры этой подготовки, а второй – за вооружение и материально-техническое обеспечение.58
Всего через два дня, 2 июня 1942 года, НКО поставил все войска ПВО и ВНОС в действующих фронтах и армиях под начало командующего артиллерией Красной Армии Воронова и его артиллерийского управления (ГАУ). С этого момента в ГАУ входил собственный отдел ПВО, который в ноябре 1942 года был преобразован в полнокровное управление.59 Воронов учредил в войсках ПВО новый штаб – Центральный штаб истребительной авиации, а также Центральный пост ВНОС, главную инспекцию и подчиненное ГАУ управление боевой подготовки. По сути дела эта июньская реформа создала в рядах Красной Армии два отдельных и четко отличающихся друг от друга рода войск противовоздушной обороны –
Когда Красная Армия зимой 1942–1943 годов активизировала свои наступательные действия и фронт постоянно продвигался на запад, стало очевидным, что организация противовоздушной обороны страны требует новых изменений. В результате
10 июня 1943 года ГКО разделил войска ПВО страны на Западный и Восточный фронты ПВО, первый – под командованием пребывающего в Москве Громадина, а второй – под руководством находящегося в Куйбышеве генерала Г. С. Зашихина.62 Одновременно Дальневосточную, Забайкальскую и Среднеазиатскую зоны ПВО вернули под управление соответствующих фронтов и военных округов, а Ленинградская армия ПВО и ПВО Ладожского района остались под оперативным управлением Ленинградского фронта.63
Вскоре после этого ГКО упразднил управление командующего ПВО страны и передал все его функции центральному штабу ПВО страны в Москве. Хотя оба фронта ВО и все войсковые соединения и части ПВО остались в прямом подчинении командующего артиллерией Красной Армии, центральный штаб ПВО страны теперь отвечал за координацию действий обоих фронтов ВО, которые разделялись по меридиональной линии от Архангельска на Белом море через Кострому и Краснодар до Сочи на Черном море.
Несущий на себе основную тяжесть войны Западный фронт ПВО к июню 1943 года включал в себя Особую московскую армию ПВО, 11 корпусных и дивизионных ПВО и 14 соединений истребительной авиации ПВО. В нем имелось 1012 пилотов-истребителей, 3106 зенитных орудий среднего калибра и 1066 орудий малого калибра, 2280 зенитных пулеметов, 1573 зенитных прожектора и 1834 аэростатных заграждения.64 Менее значимый Восточный фронт ПВО, который обеспечивал защиту жизненно важных объектов на Урале, Средней и Нижней Волге, на Кавказе и в Закавказье, состоял из Закавказской зоны ПВО, семи корпусных и бригадных районов ПВО и восьми соединений истребительной авиации; он имел 447 пилотов-истребителей, 2459 зенитных орудий среднего калибра и 800 орудий малого калибра, 1142 зенитных прожектора, 1814 зенитных пулеметов и 491 аэростат заграждения.65
Для улучшения управления войсками ПВО во время стратегических операций – таких, как оборона Курска – Центральный штаб ПВО страны часто учреждал специальные группировки сил ПВО. Например, в Курске он учредил оперативную группу войск ПВО под руководством полковника В. С. Гаврилова, начальника штаба Воронежского корпусного района ПВО. Эта группа централизовала управление войсками ПВО, защищавшими Курск и примыкающие к нему железнодорожные ветки, координировала действия сил ПВО страны и войсковых ПВО в данном районе, поддерживала тесную связь со штабами ПВО, защищавшими Центральный и Воронежский фронты. Оперативная группа Гаврилова имела под своим началом 761 зенитное орудие, свыше 200 истребителей, 558 зенитных пулеметов и 125 зенитных прожекторов.66