Нашествие гиксосов и их владычество прервало исстари налаженные торговые связи с племенами, населявшими побережье Красного моря. Хатшепсут своим походом возобновила прерванный товарообмен и установила прочные отношения с далекими окраинами Египта. «Божественная Хатшепсут занималась делами страны двух земель по собственным предначертаниям. Египет работал, склоняя голову перед ней, прекрасным божественным семенем, исшедшим из бога. Она была канатом, которым тянут Север, и столбом, к которому прикреплен Юг; она была совершенный кормчий у руля Севера, госпожа, которая отдает распоряжения, чьи превосходные начертания умиротворяют обе земли, когда она говорит», — прославляли женщину-фараона надписи в храме Амона в Карнаке.
От великой царицы Хатшепсут остались фрагменты монументальных обелисков, которые она повелела воздвигнуть в храме Амона в Карнаке. Первая пара обелисков установлена в честь ее коронации на троне фараонов Египта, а вторая пара ознаменовала торжество «хебсед», которое отмечали на 15 году правления фараона Хатшепсут.
Первые два обелиска стоят в восточной части храма Амона и, к сожалению, сильно разрушены. Наблюдал за изготовлением и установкой обелисков Сененмут, доверенный помощник царицы, который оставил следы своего присутствия на скале в каменоломне под Асуаном. «Великая царица, вознагражденная всеобщим преклонением, великая в любви, которую дал ей отец царства Ра, истинная во всех своих божественных проявлениях, Дочь Фараона, Сестра Фараона, Супруга Бога, Великая Царственная Супруга Хатшепсут…»
Хранитель печати и главный управитель имений Супруги Бога в самых цветистых выражениях докладывал божественной правительнице Верхнего и Нижнего Египта Хатшепсут, что его попечением все работы над двумя обелисками окончены: «Все было сделано, как приказано, все осуществилось по воле Вашего Величества». Поскольку при перечислении титулов правительницы не было названо ее тронное имя Мааткара, можно сделать вывод, что речь идет о первых обелисках, установленных ко времени провозглашения Хатшепсут фараоном.
Вторая пара обелисков находится в парадном зале Тутмоса I, отца Хатшепсут, между четвертым и пятым столбами. Они установлены неподалеку от обелисков отца, поэтому сразу видно, что они намного выше обелисков Тутмоса I — на 10 м. Вес этих колоссов составляет 323 т. По содержанию надписи на каменном блоке с рельефом однозначно определено, что эти обелиски установлены позже — это вторая пара. Сейчас от двух обелисков второй пары остался только один, а другой лежит разбитый на берегу священного храмового озера. Сама Хатшепсут подчеркивала, что ее сердце подсказало ей воздвигнуть эти обелиски для Амона, ее божественного отца: «Я сидела в своем дворе и размышляла о Творце. Мое сердце приказало мне возвести два обелиска, чтобы они доходили вершинами до неба, в торжественном колонном зале между двух больших столбов фараона…»
Фараон Хатшепсут правила Египтом довольно долго: по разным данным, от 20 до 22,5 года. Упоминания о ней отсутствуют после 1457 года до н. э. Не имеется никаких доказательств насильственной смерти, как нет и прямых указаний на то, что она была изгнана или бежала из Египта. Тутмос III в последние годы правления его мачехи Хатшепсут играл значительную роль в руководстве египетской армией. Он даже был назначен главнокомандующим и руководил экспедицией на Синай и двумя походами в Нубию, предпринятыми для устрашения непокорных нубийцев.
Нубия по-прежнему привлекала египтян возможностью захвата рабов, которые стали широко использоваться в частных хозяйствах не только знати, но и средних слоев населения. Нубия на протяжении веков оставалась важнейшим источником сырья, кроме того, оттуда привозили золото. Нашествие гиксосов ослабило власть Египта в Нубии, там часто вспыхивали мятежи. Поэтому поручение Хатшепсут, данное наследнику Тутмосу III, было жизненно важно для страны. Вряд ли властная женщина-фараон устранилась от дел раньше, чем Тутмос III вступил на престол в качестве полноправного фараона. Возможно, военные походы во главе войск в отдаленные области тоже были способом удалить наследника из столицы.
Первоначально у историков преобладало ошибочное предположение, что Тутмос III сразу же после смерти ненавистной мачехи поспешил начать уничтожение картушей с ее именем. Недавние исследования в так называемых камерах Хатшепсут в храме в Карнаке показывают, что во время правления Тутмоса III действительно были сколоты картуши с тронным именем Хатшепсут и лицевая часть статуй, представлявших женщину-фараона, но это произошло, скорее всего, в последние годы его правления.