В официальных документах XVIII династии Сененмут появляется в годы правления Тутмоса I в качестве хранителя печати, а потом во время правления мужа Хатшепсут Тутмоса II как главный управляющий двора Супруги Бога (Хатшепсут) и воспитатель царской дочери (Нефруры). Несколько статуй этого периода представляют Сененмута обязательно со своей подопечной Нефрурой на руках.
Когда Хатшепсут стала правительницей Египта при малолетнем Тут-мосе III (около 1490 года до н. э.), положение Сененмута при дворе укрепилось, и вскоре он был удостоен многочисленных придворных титулов, например единственный друг фараона, главный смотритель ванной комнаты, смотритель опочивальни фараона, смотритель церемониального зала и надзиратель обоих зернохранилищ храма Амона. Потом он стал главным управляющим имений Амона. В его руках находились огромные богатства храма Амона — золото, драгоценные камни, сельскохозяйственные угодья, скот и ремесленные мастерские. Сененмут превратился в одного из самых влиятельных людей в Египте. После коронации Хатшепсут он получил назначение на очень высокую должность чаги (наместника) Верхнего Египта.
Сененмут официально надзирал за строительством важнейших сооружений, возведенных при правлении женщины-фараона Хатшепсут, но, по всей вероятности, был не только чиновником, но и талантливым архитектором. Он умел воплощать в камень пожелания божественной Хатшепсут. Сененмут построил ее погребальный храм в Деир-эль-Бахри к западу от Фив («Джосер Джосеру» — «Священнейший из священных»), и, хотя он придерживался вековых традиций, его произведение отличается от соседнего храма Ментухотепа II удивительно гармоничной стройностью.
За тысячу лет до постройки греческого Парфенона этот храм уже явил миру соразмерность, устойчивость и величавую красоту. Три широкие террасы были украшены портиками с колоннами из белого камня. Массивные пандусы посредине вели наверх, к святилищу храма. Террасы храма покрывала яркая многоцветная живопись, с многочисленными изображениями царицы Хатшепсут. Коленопреклоненные колоссальные статуи и сфинксы довершали убранство храмовых террас. К первой из террас вела длинная аллея из мирровых деревьев, вдоль которой стояли сфинксы царицы. Сфинксы находились с двух сторон дороги шириной около 40 м, ведущей от нижней террасы храма к плодородным полям в долине Нила, где был поставлен высокий массивный пилон.
Перед самим храмом разбили роскошный сад из декоративных деревьев и кустарников, привезенных из дальних мест, вырыли под прямым углом друг к другу длинные каналы, наполненные водой.
Это чудо в пустынных скалах сотворил для несравненной Хатшепсут ее придворный архитектор Сененмут. Построенные им сооружения — это не только храмы и гробницы, это объяснение в любви, вдохновенная песня, исполненная в камне. Был ли он для женщины-фараона просто распорядительным чиновником и полезным советником? Или их соединяли более близкие романтические отношения? Отвечала ли она ему взаимностью? Это тайна великой Хатшепсут. В служебных отчетах о ходе строительства Сененмут обращается к своей повелительнице, как положено, с перечислением ее титулов, а себя величает ее «Возлюбленным». Что это — еще один титул вельможи?
Все тайное когда-нибудь обязательно становится явным. Окруженная личной стражей, отгороженная от всего остального мира преданными жрецами и придворными, могла ли женщина-фараон позволить себе любовную связь с дорогим ей человеком? За обладание высшей властью, какой не имели многие полноправные фараоны-мужчины, Хатшепсут заплатила отсутствием личной жизни. Только так она могла взобраться к вершине власти и удержаться там.
По обычаю Древнего Египта, после смерти фараона его сына возводили на престол по достижении 12-летнего возраста. Если законного наследника не было, но оставалась вдова царской крови, то претендент на престол брал ее в жены. Именно так, женившись на высокородной Ясмес, стал фараоном Тутмос I, отец Хатшепсут. У самой Хатшепсут не нашлось на примете такого мужчины высокого происхождения, которому она смогла бы доверить свое будущее и, в первую очередь, управление страной. Главная супруга фараона в любом случае не играла бы ведущую роль, и ей не удалось бы осуществить свои планы. Возможно, Сененмут был именно тем человеком, о каком она мечтала. Но как же кровь фараонов? Сененмут происходил из незнатной семьи, а дочь Бога не имела права осквернить себя союзом с простолюдином.
Близость Хатшепсут со своим придворным зодчим, наверное, была известна всем царедворцам. Она, очевидно, доверяла Сененмуту и в ответ на его искреннюю преданность позволила ему построить его гробницу рядом со своей — небывалое проявление благоволения со стороны фараона. Но его гробница найдена пустой, мумия Сененмута не обнаружена, как и мумия самой Хатшепсут.