В отношении целей и методов борьбы ни среди партизан, ни среди оккупантов не было никакого единства. Партизаны нередко боролись огнем и мечом друг против друга. Оккупанты часто мешали друг другу в выполнении поставленных задач. Там ЭДЕС боролась против ЭЛАС, здесь Михайлович выступал против Тито, а Недич, поставленный немцами во главе сербского правительства, выступал против обоих. Итальянцы устраивали столкновения с немцами, усташи — с вермахтом, дипломаты шли против генералов, полиция против военных. Это был ведьмин котел недальновидных интересов и интриг, обусловленный отсутствием четкости политической концепции, а расплачиваться за все приходилось местным жителям. Последним ничего не оставалось делать, кроме как следовать древней традиции — уходить «в лес». Таким образом, число повстанцев росло благодаря царившему повсюду хаосу. Вынужденные перейти к обороне, обе оккупационные державы стали ограничиваться только отнимавшей почти все имевшиеся в их распоряжении силы охраной наиболее важных коммуникаций. Лишь иногда они отваживались нанести партизанам удар. Весной 1943 года генерал-полковник Лёр, бывший в то время командующим германскими войсками на Балканах, организовал и провел облаву на партизан, к которой были привлечены все имевшиеся у немцев силы. В результате на оккупированных Германией и Болгарией территориях была уничтожена большая часть партизанских отрядов.
Тем временем пожар войны снова запылал в сердце Европы. Балканский полуостров опять оказался в сфере больших операций. После потери всех территорий в Африке ОКВ стало опасаться возможности высадки англо-американских войск в Греции. Поэтому немцы создали новую группу армий («Юго-Восток») во главе с генерал-фельдмаршалом фон Вейхсом, которому были подчинены все вооруженные силы на Балканах. Ему была поставлена задача отразить любые атаки врага.
Наступил конец августа 1943 года. Исход сражения за Сицилию уже решился в пользу наступающих, и боевые действия переместились в Южную Италию. Однако возможность ведения западными союзниками параллельной операции против Балкан не только сохранялась, но и в связи с намечавшейся капитуляцией Италии существенно возросла. С выходом Италии из войны все побережье Адриатического моря от Фиуме (Риека) до Додеканеса становилось открытым. Только готовые к такому развитию событий немцы, располагая лишь относительно слабыми силами, сразу же после того, как правительство Бадольо подписало 3 октября 1943 года перемирие с союзниками (а 13 октября объявило Германии войну), сумели повсеместно захватить ключевые позиции, раньше, чем итальянцы сделали для себя соответствующие выводы. На островах Родос, Кос и Лерос, куда тайком уже проникли английские отряды, происходили серьезные бои.
Определить значение этой интермедии, а также ее возможные последствия, в частности в отношении Турции, сумели только Черчилль и немцы, которые, несмотря на нависшую над Римом опасность, перебросили часть своей боевой авиации на юго-восток. С ее помощью горстке германских моряков и пехотинцев в течение нескольких недель удалось полностью овладеть положением в районе Эгейского моря.
Тито и другие партизанские командиры упустили подходящий момент. Партизанские части были не в состоянии сковать германские войска, то есть помешать им делать то, что они хотели. Правда, повстанцам в разных местах удалось захватить в свои руки большое количество оружия и припасов, находившихся на итальянских складах. В остальном же после капитуляции Италии, по крайней мере на Балканах, политическая обстановка стала менее запутанной и управление оккупированными областями упростилось.
Вопрос, как должен был решать свою задачу командующий группой армий «Юго-Восток» на территориях, контролировавшихся раньше итальянцами, вскоре явился причиной возникновения больших разногласий между ним и Верховным главнокомандованием.