Части 16-го стрелкового корпуса, расположенные в лагерях под Казлу-Рудой, выступили по тревоге в 7.30 22 июня и встретились с противником уже на марше. К тому моменту действующим указанием для соединений 16-го ск был приказ № 01 командования 11-й армии:
«Частями 5-й стрелковой дивизии оборонять 1, 2 и 3 узлы обороны Ковенского укрепленного района на рубеже Шаудыня, Зыкле, Шварпле.
33-й стрелковой дивизии – 4, 5 и 6 [узлы обороны] Ковенского укрепленного района на рубеже Слизновиэна, фл. Румки, Воишвилы, Дворкеле.
Немецкие солдаты у «таможни» на границе с Литвой у Эйдкау (Эйдкунен, ныне Чернышевское). В Литве по другую сторону границы находится город Кибартай.
188-й стрелковой дивизии – 7, 8 и 9 узлы обороны Ковенского укрепленного района на рубеже Кунигишки, Ковнишки, Мялуцишки, Венкшнупе, выделив один батальон для прикрытия десятого узла обороны Ковенского укрепленного района – район Морги, Ивашки, Калвария».[133]
В наихудшем положении находилась 188-я стрелковая дивизия, которая должна была выйти на левый фланг корпуса из летних лагерей. Полки 5-й стрелковой дивизии находились в лучшем положении, их отделяло меньшее расстояние. Необходимо отметить, что командиры 142-го сп подполковник И. Г. Шмаков и 190-го сп подполковник П. С. Телков находились с передовыми батальонами. Поэтому полки вели заместители командиров по политчасти. 336-й полк вел исполняющий обязанности командира майор И. Н. Коновалов.
Возможно, тот факт, что 336-й полк вел его командир, способствовал импровизации, улучшившей положение советских частей. Около 13.00 подразделения полка при поддержке артдивизиона 174-го гаубичного артполка (один из двух полков 5-й сд) нанесли контрудар во фланг 415-му и 418-му полкам 123-й пехотной дивизии. Контрудар оказался для немцев неожиданным, наибольшую сумятицу внес артиллерийский налет на штаб 418-го полка. Бой разгорелся на несколько часов. Немцы отреагировали подтягиванием артиллерии. В итоге наносившие контрудар подразделения были оттеснены за реку Нова, а артиллерийский дивизион попал в окружение. Его командир А. С. Воскресенский погиб (посмертно награжден орденом Красного Знамени).
Подходившие из летних лагерей батальоны вступили в соприкосновение с противником в середине дня и перешли в контратаки локального значения. Как отмечалось в ЖБД 16-го ск, «бои на границе приняли характер встречного боя».[134]
Ситуация усугублялась недооценкой противника. В разведсводке 5-й сд от 14.00 22 июня 1941 г. указывалось: «На фронте 5 сд наступает до 1 ПД с двумя ротами танков. Нумерация частей противника не установлена».[135] Советские контратаки были немцами отражены, ни о каком выходе в узлы обороны УРа не было и речи. Командир корпуса М. М. Иванов обратился к командующему армией с предложением «корпус отвести на зап. опушку Козло-Рудского леса…».[136] Отход был санкционирован В. И. Морозовым и начался около 17.00 22 июня.В относительно выгодном положении в ряду соединений 16-го ск находилась 33-я стрелковая дивизия генерал-майора К. А. Железникова. Ее батальоны находились не в летних лагерях и могли быстрее соединиться с выдвинутыми к границе подразделениями (три стрелковых батальона плюс разведывательный батальон).
Как указывается в ЖБД 33-й сд, «В 4 часа по телефону из штаба корпуса было получено боевое распоряжение о выводе частей из мест дислокации в районы, заранее намеченные для обороны, одновременно предупреждались не поддаваться на провокации со стороны фашистской Германии».[137]
Предупреждение о «провокациях», конечно, сковывало действия, но иллюзий достаточно быстро не осталось.Основным противником дивизии К. А. Железникова являлась 121-я пехотная дивизия. Главный удар она наносила в 7-километровой полосе двумя полками (405-м и 407-м) в центре своей полосы. Соединению была поставлена задача «нанося удар южнее озера Поезеры, занимает Вильковышки и захватывает переправу через Шешупе у Пильвишки».[138]
Это означало удар вдоль шоссе и железной дороги на Пильвишки.В этом месте граница и р. Шешупа расходились в разные стороны. Однако пограничной рекой становилась Лепона, поэтому захват мостов оставался актуальным. Немецкий план предполагал атаку без артиллерийской подготовки. Штурмовая группа II батальона 505-го полка в первые минуты вторжения попыталась захватить автомобильный и железнодорожный мосты через Лепону в районе Кибартая. Эту атаку пограничникам удалось отбить, но остановить удар в глубину им не удалось: немецкая пехота форсировала реку вброд и ворвалась в приграничный город Кибартай и на станцию Вержболово. Упорство пограничников в обороне мостов заставило немцев ввести в дело артиллерию: в 4.44 начинается обстрел здания погранкомендатуры. После повторной атаки, на этот раз подразделениями 407-го полка, оба моста попадают в руки немцев неповрежденными. Здесь же, под Кибартаем, состоялся бой между броневиками БА-10 разведбата 33-й стрелковой дивизии и штурмовыми орудиями немцев.