1968 г. Первые четыре лекции этого курса в переработанном виде выходят в 1974 году под названием «Философия и спонтанная философия ученых» (пятая лекция, посвященная вопросу об истине, остается неопубликованной). Кроме того, в лекции «Ленин и философия», прочитанной 24 февраля 1968 г. во Французском философском обществе (и изданной в 1969 г. в серии «Теория»), Альтюссер дает новое определение философии как «политики в теории» («Философия представляла бы тогда политику в области теории, точнее говоря, в области наук, — и наоборот, философия представляла бы научность в политике, в области, занимаемой классами, ведущими классовую борьбу»).
В мае 1968 г. Альтюссер, вновь госпитализированный в связи с депрессивным срывом, отсутствует в Латинском квартале. Пытаясь post factum понять и оценить событие, он характеризует его как «идеологическое массовое восстание». Переписка и попытки теоретического осмысления, которые относятся к этой теме, сегодня доступны читателю, в частности статья «По поводу статьи Мишеля Верре о Студенческом мае», напечатанная в La Pensée, № 145, и письма, опубликованные Марией-Антуанеттой Маччиочи в ее книге Lettere dall'interno del PCI a Louis Althusser, Фельтринелли, 1969 (но изъятые из французского издания). Наконец, и в особенности, статья «Идеология и идеологические аппараты государства» (La Pensée, № 151, 1970), являющаяся частью незавершенной работы «Государство, Право, Надстройка», написанной в 1969 году. В ней мы можем найти, в частности, следующую интерпретацию: «Идеология интерпеллирует индивидов как субъектов. Результат:… субъекты «функционируют», и в огромном большинстве случаев все они, за исключением «дурных субъектов», «функционируют без чужой помощи»…». После возобновления университетских занятий Альтюссер подвергается резким нападкам со стороны маоистов из «Дела народа», которые называют его пособником ревизионизма. Со своей стороны, руководство ФКП продолжает считать, что с него нельзя спускать глаз (voir en lui leur maître à penser)… Тем не менее «Юманите» публикует в рубрике «Идеи» наиболее существенные выдержки из написанного им предисловия к новому изданию первого тома «Капитала», вышедшему в издательстве «Фламмарион».
В 1970 году Альтюссер пишет предисловие к книге Марты Арнекер «Элементарные начала исторического материализма» (Principios elementales del materialismo histórico, Siglo XXI, México — Buenos Aires), которая расходится тиражом в миллион экземпляров («Классовая борьба не является (производным) эффектом существования классов: классовая борьба и существование классов — одно и то же»). Вместе с другими текстами, в которых также находит выражение тезис «классовой борьбы в теории» (в частности, в интервью газете «Унита» «Философия как оружие революции», 1968), этот текст будет включен в сборник «Позиции», опубликованный в 1976 г. в Éditions sociales. Влияние Альтюссера в Латинской Америке достигает своего пика; некоторые латиноамериканские активисты и интеллектуалы видят в нем чуть ли не нового Маркса, но в то же время его идеи становятся материалом для ожесточенных дискуссий и мишенью для резкой критики.
В 1973 и 1974 гг. Альтюссер выражает свою новую концепцию марксистской философии в двух коротких текстах: «Ответ Джону Льюису», в котором он, вступая в полемику с британским коммунистом, придает своей критике философского гуманизма более жесткую форму и характеризует «сталинское отклонение» как аватар «пары экономизм/гуманизм»; и «Элементы самокритики» (Hachette Littérature), где он, говоря о себе и своих учениках, в частности, пишет: «Если мы не были структуралистами… то мы были виновны в другой столь же сильной и компрометирующей страсти: мы были спинозистами».
В 1975 году он «по совокупности изданных работ» защищает докторскую диссертацию в Пикардийском университете (см. «Амьенская лекция», переизданная в «Позициях»: «Я вспоминаю о Макиавелли, правило метода которого, редко выражавшееся, но всегда применявшееся, заключалось в том, что в мышлении нужно доходить до предела»). В следующем году он вступает в брак с Элен Ритман (известной как Леготьен в движении Сопротивления и в своей профессиональной деятельности), бывшей его спутницей жизни в течение тридцати лет и работавшей социологом в SEDES, где она исследовала, в частности, реакции французского и африканского крестьянства на политику сельского развития и благоустройства территорий.