Помимо конверсии огромного военно-промышленного комплекса, сложившегося в ходе войны, с его быстрейшей модернизацией на нужды народного хозяйства встала проблема создания двух принципиально новых систем оружия. А именно, для гарантии безопасности страны требовалось производить ядерное оружие и средства его доставки (баллистические ракеты). Большое число ведомств стало кооперировать свою работу через участие в межотраслевых целевых программах, и это был качественно новый тип государственного управления, хотя изменялась не столько структура органов, сколько их функции. Такие изменения меньше заметны, нежели структурные, но
Конверсия военной промышленности была проведена быстро, повысив технический уровень гражданских отраслей и позволив затем перейти к созданию новых военных производств. Наркомат боеприпасов был перестроен в Наркомат сельскохозяйственного машиностроения. Наркомат минометного вооружения стал Наркоматом машиностроения и приборостроения. Наркомат танковой промышленности превратился в Наркомат транспортного машиностроения.
Также для управления восстановительными работами на несколько лет были созданы специализированные министерства (в том числе путем выделения из НКВД, с его строительными организациями): Наркомат по строительству предприятий тяжелой индустрии, Наркомат по строительству топливных предприятий и другие.
Переход «на мирные рельсы» в общественном сознании произошел в конце 1947 года с отменой карточек и денежной реформой.
Во время реформы наличные деньги обменивали в соотношении 10: 1, а сбережения населения – в зависимости от суммы. До 3 тыс. рублей меняли 1: 1, от 3 до 10 тыс. – 3: 2, от 10 до 100 тыс. – 2: 1, свыше 100 тыс. – 10: 1, займы – 3: 1. Сельские жители, хранившие деньги в «кубышках» (сберкасс в деревнях просто не было), потеряли более половины сбережений, население в целом – треть.
Можно усмотреть в этом очередную несправедливость, а можно и понять, что таким образом страна не только получила средства для дальнейшего развития, но и усилила свою финансовую систему. Для сохранения этой системы СССР пошел на важный шаг: отказался вступить в МВФ и Международный банк реконструкции и развития, а 1 марта 1950 года вообще вышел из долларовой зоны, переведя определение курса рубля на золотую основу. В СССР были созданы крупные золотые запасы, а рубль был неконвертируемым, что позволяло поддерживать очень низкие цены и не допускать инфляции.
В 1948 году страна достигла и превзошла довоенный уровень промышленного производства, что по нормальным меркам немыслимо. Это было достигнуто за счет возобновления производства на территориях, освобожденных от фашистской оккупации. Восстановленные заводы оснащались оборудованием, произведенным на заводах Германии и поставленным в счет репараций. Однако восстановление промышленности происходило на основе воспроизведения устаревших по мировым стандартам технологий 1930-х годов. Так закладывалось структурное отставание промышленности от мирового уровня на 15–20 лет, особенно в области производства потребительских товаров и услуг.
Очень быстро была создана атомная промышленность. В 1948 году на Урале вступил в строй комбинат «Маяк» (Челябинск-40), на нем были сооружены первые отечественные ядерные реакторы – конверторы для получения плутония. Комбинат «Маяк» стал первым ядерным центром страны. Именно здесь получили первые килограммы плутония– 239, из которого изготавливали заряды первых атомных бомб. Параллельно с развитием производства атомного оружия шло становление ракетной промышленности.